113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0868 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0868  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  833    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0855  AAA ATPase  30.36 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127796  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1347  AAA ATPase  31.97 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.346688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  29.2 
 
 
574 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1868  AAA ATPase  30.87 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.851446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  29.41 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.54 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1401  AAA ATPase  26.94 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1966  AAA ATPase  28.32 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0234546  hitchhiker  0.0000000000969373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2148  AAA ATPase  28.62 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1081  AAA ATPase  28.57 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0976965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  35.38 
 
 
563 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  34.51 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  28.9 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0525  putative ATP binding protein  27.71 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  36.15 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  26.87 
 
 
573 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1279  hypothetical protein  31.09 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.114158  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0649  hypothetical protein  29.04 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.480277  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0223  AAA ATPase  27.02 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0653729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  26.85 
 
 
496 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  23.67 
 
 
559 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  30.07 
 
 
574 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  33.99 
 
 
570 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 
570 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1669  AAA ATPase  29.44 
 
 
341 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  23.66 
 
 
565 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0978  putative ATP binding protein  28.57 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.6362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0655  AAA ATPase  28.92 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.87337 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1800  hypothetical protein  28.14 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.13462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  26.43 
 
 
510 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  34.62 
 
 
560 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  28.64 
 
 
569 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  25.84 
 
 
491 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25.74 
 
 
550 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  22.79 
 
 
502 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1841  hypothetical protein  33.56 
 
 
164 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.384514  hitchhiker  0.00417273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  24.84 
 
 
519 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 
481 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
481 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  22.97 
 
 
502 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0406  AAA ATPase  31.58 
 
 
335 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 
481 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 
510 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 
491 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  25.86 
 
 
498 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0411  putative ATP binding protein  29.54 
 
 
394 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.575992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  24.92 
 
 
508 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 
498 aa  56.6  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  25.43 
 
 
509 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.05 
 
 
528 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  24.8 
 
 
481 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 
504 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  23.31 
 
 
501 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  24.11 
 
 
492 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  25 
 
 
488 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  25.43 
 
 
509 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  25.66 
 
 
489 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  22.43 
 
 
479 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  24.14 
 
 
509 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  25.09 
 
 
514 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.93 
 
 
484 aa  53.5  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  22.98 
 
 
482 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  25 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  23.43 
 
 
512 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  22.79 
 
 
499 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  25 
 
 
500 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  24.57 
 
 
512 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  23.76 
 
 
532 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0451  hypothetical protein  27.5 
 
 
161 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  28.67 
 
 
506 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  24.82 
 
 
498 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  21.86 
 
 
512 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  30.97 
 
 
575 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  23.68 
 
 
520 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  30.97 
 
 
575 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  22.9 
 
 
519 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  29.03 
 
 
567 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  23.45 
 
 
521 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  23.45 
 
 
521 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  23.72 
 
 
519 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  27.98 
 
 
514 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  27.89 
 
 
507 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  27.89 
 
 
507 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  26.69 
 
 
497 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  25.59 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 
497 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.78 
 
 
483 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  22.93 
 
 
496 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1843  AAA ATPase  25.36 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0150379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  25.34 
 
 
497 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2049  AAA ATPase  27.6 
 
 
334 aa  47  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.633542 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  22.81 
 
 
480 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  28.35 
 
 
443 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
480 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  24.68 
 
 
507 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  23.23 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  23.49 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>