256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5592 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  963    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  88.75 
 
 		 480 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  80.84 
 
 		 481 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  43.31 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  45.16 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  41.51 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  43.51 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  41.54 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  42.67 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  43.19 
 
 		 501 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  42.24 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 		 504 aa  362  8e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  42.13 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  42.67 
 
 		 505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  42.09 
 
 		 505 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  42.03 
 
 		 520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  42.03 
 
 		 520 aa  352  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  41.11 
 
 		 508 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  41.01 
 
 		 507 aa  349  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  42.23 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 		 504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  40.33 
 
 		 489 aa  342  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  39.79 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  41.85 
 
 		 498 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.07 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  42.7 
 
 		 496 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  39.57 
 
 		 505 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 		 497 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  40.09 
 
 		 494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  32.48 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  31.76 
 
 		 499 aa  239  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  32.2 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  31.89 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  29.36 
 
 		 492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  31.94 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  29.91 
 
 		 482 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  29.55 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  32.69 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  29.74 
 
 		 483 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.43 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  30.8 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  30.65 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  29.76 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  29.85 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  29.85 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  29.79 
 
 		 509 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  28.66 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  27.25 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  27.86 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  28.14 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6936  hypothetical protein  45.26 
 
 		 244 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  27.49 
 
 		 498 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  27.67 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  28.81 
 
 		 491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.43 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  27.27 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  28.18 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  27.71 
 
 		 509 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  28.27 
 
 		 500 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 		 521 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 		 521 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  26.77 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.48 
 
 		 565 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  27.83 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  29.62 
 
 		 575 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  29.81 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  27.83 
 
 		 500 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  25.85 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  27.2 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  26.9 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  29.24 
 
 		 481 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.74 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  27.59 
 
 		 584 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 514 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.51 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  26.83 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  27.56 
 
 		 569 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  26.64 
 
 		 573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  26.58 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  26.64 
 
 		 562 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 481 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.41 
 
 		 574 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  28.17 
 
 		 570 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 481 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.12 
 
 		 563 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  27.62 
 
 		 570 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  26.97 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  26.22 
 
 		 574 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  26.56 
 
 		 575 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  26.56 
 
 		 575 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 		 461 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  25.11 
 
 		 559 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  26.16 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  27.65 
 
 		 479 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  25.89 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>