208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3295 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  100 
 
 		 504 aa  1023    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  63.31 
 
 		 506 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  64.98 
 
 		 507 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  64.98 
 
 		 507 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  66.06 
 
 		 514 aa  675    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  67.21 
 
 		 510 aa  695    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  66.93 
 
 		 510 aa  700    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  55.96 
 
 		 509 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  53.44 
 
 		 528 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  52.74 
 
 		 519 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  52.54 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  52.54 
 
 		 519 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  52.12 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  52.12 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  52.33 
 
 		 519 aa  519  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  51.3 
 
 		 514 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  52.63 
 
 		 521 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  52.63 
 
 		 521 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  52.92 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  53.94 
 
 		 488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  51.45 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  51.22 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  51.45 
 
 		 498 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  52.6 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  51.45 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  51.24 
 
 		 509 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  37.58 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  37.58 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  37.45 
 
 		 560 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  36.89 
 
 		 562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  35.71 
 
 		 569 aa  302  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  36.36 
 
 		 559 aa  299  9e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  37.86 
 
 		 575 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  37.01 
 
 		 567 aa  296  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  35.57 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  37.04 
 
 		 570 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  36.89 
 
 		 570 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  36.34 
 
 		 575 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  36.34 
 
 		 575 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  36.33 
 
 		 562 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  35.87 
 
 		 573 aa  289  9e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  34.82 
 
 		 574 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  35.44 
 
 		 565 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  35.39 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  33.69 
 
 		 484 aa  223  9e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  28.1 
 
 		 550 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 535 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  29.92 
 
 		 499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  29.98 
 
 		 496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  30.96 
 
 		 494 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  31.16 
 
 		 494 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  30.12 
 
 		 498 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  30.35 
 
 		 505 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 		 497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  30.63 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  30.04 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.68 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  27.76 
 
 		 482 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  29.14 
 
 		 496 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  26.85 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  27.67 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  29.57 
 
 		 501 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  28.48 
 
 		 502 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  26.91 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  29.25 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  28.26 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  28.05 
 
 		 508 aa  153  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  26.87 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 494 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  27.37 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  24.84 
 
 		 454 aa  146  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  35.81 
 
 		 259 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  27.42 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  26.56 
 
 		 506 aa  143  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 		 497 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  27.37 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  27.84 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.75 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 		 507 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 502 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  27.48 
 
 		 505 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.8 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  26.75 
 
 		 481 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.11 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 481 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  27.41 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 491 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>