More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6728 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 474 aa  962    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  36.79 
 
 		 528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  36.46 
 
 		 519 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  36.29 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  35.47 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  36.05 
 
 		 519 aa  300  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  36 
 
 		 512 aa  299  7e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  35.82 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  36.5 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  35.82 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  36.5 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  36.5 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  36.5 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  36.09 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  36.52 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  36.48 
 
 		 514 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  35.1 
 
 		 520 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  35.65 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  34.62 
 
 		 521 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  34.62 
 
 		 521 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  35.04 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  35.65 
 
 		 500 aa  292  9e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  34.55 
 
 		 519 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  33.9 
 
 		 510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  33.69 
 
 		 510 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  35.39 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  33.4 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  32.69 
 
 		 562 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  33.26 
 
 		 563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  32.78 
 
 		 570 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.99 
 
 		 575 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  32.42 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  32.7 
 
 		 560 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.04 
 
 		 559 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  29.83 
 
 		 569 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  30.64 
 
 		 574 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  31.91 
 
 		 562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  32.2 
 
 		 567 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  29.94 
 
 		 574 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  32.13 
 
 		 575 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  32.13 
 
 		 575 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.69 
 
 		 565 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.87 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 		 484 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25.26 
 
 		 550 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  26.82 
 
 		 478 aa  143  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  28.12 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  24.89 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  27.25 
 
 		 502 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  26.93 
 
 		 483 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  26.62 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  27.07 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.78 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  26.68 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  26.99 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  27.31 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  25.79 
 
 		 535 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.42 
 
 		 497 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  26.58 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  28.09 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.92 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  25.53 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.58 
 
 		 496 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  26.18 
 
 		 508 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  26.09 
 
 		 482 aa  123  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  25.41 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  25.32 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  26.18 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  24.19 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  25.77 
 
 		 518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  24.74 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  25.57 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  24.79 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  26.61 
 
 		 497 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  25.52 
 
 		 492 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  26.48 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  29.83 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  26.77 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  26.27 
 
 		 505 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  26.64 
 
 		 494 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  24.84 
 
 		 481 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  30.97 
 
 		 224 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5173  non-specific serine/threonine protein kinase  25.31 
 
 		 501 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  31.47 
 
 		 402 aa  98.2  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 463 aa  97.1  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>