More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3984 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  89.3 
 
 
570 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  75.23 
 
 
563 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  100 
 
 
570 aa  1147    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  75.22 
 
 
560 aa  861    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  75.36 
 
 
562 aa  854    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  58.47 
 
 
584 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  61.03 
 
 
575 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  61.03 
 
 
575 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  54.33 
 
 
569 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  57.04 
 
 
567 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  54.38 
 
 
574 aa  608  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  55.25 
 
 
575 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  54.27 
 
 
574 aa  600  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  55.92 
 
 
562 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  52.95 
 
 
573 aa  588  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  50.56 
 
 
559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  49.73 
 
 
565 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  40.79 
 
 
509 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  39.31 
 
 
512 aa  340  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  36.59 
 
 
519 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  39.48 
 
 
484 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  39.18 
 
 
488 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  38.71 
 
 
509 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  38.25 
 
 
510 aa  333  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  38.79 
 
 
512 aa  333  6e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  38.49 
 
 
509 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  38.53 
 
 
498 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  36.83 
 
 
528 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  35.17 
 
 
519 aa  329  8e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  38.06 
 
 
509 aa  329  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  33.27 
 
 
550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  37.85 
 
 
510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  37.58 
 
 
512 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  35.48 
 
 
519 aa  322  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  37.72 
 
 
514 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  38.06 
 
 
520 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  36.97 
 
 
521 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  36.97 
 
 
521 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  37.23 
 
 
500 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  37.23 
 
 
500 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  36.33 
 
 
514 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  36.53 
 
 
506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  36.89 
 
 
504 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  35.51 
 
 
507 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  35.51 
 
 
507 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  31.94 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  29.35 
 
 
499 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  28.78 
 
 
508 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
504 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  28.78 
 
 
496 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  29.52 
 
 
502 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  29.32 
 
 
492 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  29.48 
 
 
501 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.41 
 
 
478 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  29.16 
 
 
504 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
498 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  30.33 
 
 
498 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  30.58 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  29.72 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  28.12 
 
 
489 aa  148  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
500 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  27.36 
 
 
518 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  26.38 
 
 
535 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  27.09 
 
 
492 aa  144  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  26.09 
 
 
454 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
502 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.97 
 
 
459 aa  136  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
497 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
503 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.8 
 
 
494 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  28.07 
 
 
505 aa  134  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  27.37 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  33.05 
 
 
259 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  26.38 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.51 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  27.12 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 
506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  26.53 
 
 
494 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 
520 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  29.09 
 
 
505 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  28.29 
 
 
520 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  26.91 
 
 
505 aa  124  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.52 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.82 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4235  ATPase-like protein  51.22 
 
 
171 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.147288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  28.17 
 
 
480 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  25.2 
 
 
497 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 
494 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  27.29 
 
 
492 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 
461 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  32.61 
 
 
402 aa  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 
481 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  32.44 
 
 
362 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
481 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>