109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4235 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4235  ATPase-like protein  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  56.69 
 
 		 575 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  55.73 
 
 		 562 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  56.69 
 
 		 575 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  51.47 
 
 		 559 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  56.15 
 
 		 567 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  50 
 
 		 569 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  57.6 
 
 		 574 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  49.61 
 
 		 584 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  50.38 
 
 		 574 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  52.42 
 
 		 573 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  50 
 
 		 575 aa  130  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  51.22 
 
 		 570 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  51.22 
 
 		 562 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  49.59 
 
 		 563 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  50 
 
 		 560 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  47.97 
 
 		 570 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  48.39 
 
 		 565 aa  117  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  43.55 
 
 		 528 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  36.09 
 
 		 509 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  38.14 
 
 		 488 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  38.81 
 
 		 519 aa  87  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  39.13 
 
 		 514 aa  87  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  37.01 
 
 		 498 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  36.64 
 
 		 509 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  37.8 
 
 		 509 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  37.9 
 
 		 500 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  34.31 
 
 		 512 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  37.9 
 
 		 500 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  35.43 
 
 		 512 aa  84.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  41.13 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  36.49 
 
 		 509 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  35.59 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  37.9 
 
 		 519 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  37.93 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  40 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  37.93 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  37.24 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  39.32 
 
 		 484 aa  75.1  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  37.41 
 
 		 510 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  35.51 
 
 		 514 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  36.13 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  35.66 
 
 		 506 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  33.9 
 
 		 504 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  34.01 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  34.01 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  34.78 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  37.76 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  33.72 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  34.78 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  34.83 
 
 		 454 aa  55.1  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  32.63 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  32.14 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 		 496 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  35.87 
 
 		 320 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 		 241 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  34.62 
 
 		 259 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  29.29 
 
 		 257 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  36.84 
 
 		 287 aa  52.4  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  29.17 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 		 258 aa  52  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  36.36 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  28.72 
 
 		 262 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  31.51 
 
 		 241 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  31.3 
 
 		 497 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  29.89 
 
 		 229 aa  48.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  35.9 
 
 		 482 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  39.68 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  32 
 
 		 242 aa  45.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  32 
 
 		 242 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  42.86 
 
 		 480 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  32.18 
 
 		 267 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 		 461 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  34.43 
 
 		 481 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 503 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  34.18 
 
 		 494 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 489 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  29.7 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  34.18 
 
 		 505 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  29.33 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  29.35 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  30.56 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  31.08 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  26.11 
 
 		 498 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 503 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 		 480 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  34.67 
 
 		 494 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  31.03 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  31.03 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  32.43 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 		 497 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  40.98 
 
 		 532 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 		 499 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  32.47 
 
 		 280 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.67 
 
 		 505 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  29.89 
 
 		 271 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  32.89 
 
 		 478 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  28.95 
 
 		 550 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>