More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0246 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  77.18 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  67.08 
 
 		 242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  29.63 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  30.97 
 
 		 344 aa  108  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  28.26 
 
 		 514 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.4 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.02 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.02 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.39 
 
 		 510 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  31.49 
 
 		 567 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  29.82 
 
 		 362 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  28.7 
 
 		 402 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.96 
 
 		 528 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  30.57 
 
 		 482 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  26.96 
 
 		 519 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  31.03 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  32.38 
 
 		 489 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.69 
 
 		 565 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 		 519 aa  92.8  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 		 504 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 		 488 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  30.57 
 
 		 575 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  30.57 
 
 		 575 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  26.96 
 
 		 519 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  30.8 
 
 		 575 aa  92  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.26 
 
 		 559 aa  92  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.74 
 
 		 562 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 503 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  27.88 
 
 		 521 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  27.88 
 
 		 520 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  26.52 
 
 		 512 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  30.83 
 
 		 573 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  27.88 
 
 		 521 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  30.6 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  27.56 
 
 		 512 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  28.1 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  27.39 
 
 		 494 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  30.25 
 
 		 472 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 		 509 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 		 509 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  26.96 
 
 		 498 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 		 496 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  30.9 
 
 		 574 aa  89.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  28.88 
 
 		 560 aa  88.6  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  29.31 
 
 		 584 aa  88.6  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  28.32 
 
 		 484 aa  88.6  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  26.09 
 
 		 512 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  26.75 
 
 		 500 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  26.96 
 
 		 509 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 503 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  29.8 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  26.75 
 
 		 500 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  28.19 
 
 		 509 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  26.86 
 
 		 285 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  29.96 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  28.16 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  28.51 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  27.76 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28.88 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  27.19 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  27.16 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  29.58 
 
 		 570 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 		 563 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  28.33 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  28.32 
 
 		 562 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  29 
 
 		 496 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 500 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  29.49 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  28.51 
 
 		 569 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  26.86 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.31 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  26.94 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  27.2 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30 
 
 		 570 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 506 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  29.2 
 
 		 574 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  27.07 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 507 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  28.78 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  26.67 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  25.33 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  26.84 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  29.57 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  27.51 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 		 514 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  29.07 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  26.64 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  25.78 
 
 		 520 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  29.06 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 520 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  30.49 
 
 		 518 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>