171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1662 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 472 aa  919    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  68.25 
 
 		 344 aa  345  7e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  69.87 
 
 		 402 aa  339  5e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  64.79 
 
 		 362 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  43.48 
 
 		 234 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  39.74 
 
 		 232 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  39.3 
 
 		 229 aa  183  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  39.66 
 
 		 237 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  31.91 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  31.51 
 
 		 512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  31.09 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  30.54 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  31.22 
 
 		 519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 		 519 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  28.99 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  28.99 
 
 		 509 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  30.64 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  29.36 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  28.99 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  30.64 
 
 		 500 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 		 521 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 		 521 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  30.9 
 
 		 528 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.4 
 
 		 242 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.4 
 
 		 242 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  29.06 
 
 		 514 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  29.32 
 
 		 250 aa  99.8  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  30.34 
 
 		 520 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  32.2 
 
 		 241 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  29.66 
 
 		 467 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  31.28 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  30 
 
 		 259 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  28.22 
 
 		 506 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  32.33 
 
 		 560 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  30.38 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  30.38 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 570 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  32.48 
 
 		 563 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  27.38 
 
 		 285 aa  90.1  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  32.62 
 
 		 562 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 		 242 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  32.16 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  28.86 
 
 		 283 aa  88.6  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 		 262 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  32.62 
 
 		 570 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.34 
 
 		 510 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  29.58 
 
 		 497 aa  87  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  28.46 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  25.87 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.79 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  30.05 
 
 		 497 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  30.84 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  30.05 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.66 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  29.91 
 
 		 241 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  24.8 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  27.13 
 
 		 293 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  29.75 
 
 		 569 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  26.75 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  26.48 
 
 		 247 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  32.34 
 
 		 285 aa  79.7  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  29.74 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  28.39 
 
 		 235 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  29.61 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  27.96 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  30.97 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  28.49 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  25.53 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.12 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  28.14 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  29.96 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  29 
 
 		 584 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  26.22 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  27.24 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  27.96 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  29.65 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  25.53 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.59 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  31.28 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  30.05 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  26.83 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  34.52 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.83 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  29.57 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  29.08 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  25.21 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  31.11 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  28.81 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  29 
 
 		 265 aa  69.7  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  24.78 
 
 		 228 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  26.61 
 
 		 286 aa  69.7  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>