More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1144 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 265 aa  532  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  60.47 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  39.16 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  38.02 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  37.64 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  36.88 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  35.98 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  37.61 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  37.61 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  36.56 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  37.89 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  36.12 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  35.06 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  36.12 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  34.18 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  31.88 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  34.8 
 
 		 518 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  30.09 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  28.4 
 
 		 550 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  31.56 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  26.74 
 
 		 509 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  30.88 
 
 		 402 aa  92  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  31.44 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  26.81 
 
 		 514 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  28.81 
 
 		 510 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  29 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  28.81 
 
 		 510 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  30.63 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  31.14 
 
 		 362 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  28.9 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  28.9 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  29.44 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  31.05 
 
 		 484 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  30.22 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  27.98 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  28.44 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  28.77 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.98 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  27.98 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  28.87 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.51 
 
 		 565 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  30.73 
 
 		 504 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  53.62 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  29.82 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  26.4 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.17 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  25.67 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  27.75 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  24.38 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  27.52 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.52 
 
 		 509 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  27.52 
 
 		 509 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  28.21 
 
 		 501 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 491 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  27.6 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  29 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  26.77 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  24.38 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  27.13 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  26.2 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  24.38 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  26.53 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.46 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.27 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  25.7 
 
 		 519 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  29.27 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  27.46 
 
 		 494 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.78 
 
 		 574 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 		 532 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  26.98 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  26.61 
 
 		 562 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  29.25 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  28.31 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  26.77 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  34.19 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  25.65 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  26.98 
 
 		 575 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  32.28 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  26.95 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24.8 
 
 		 569 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0822  signal transduction ATPase  24.68 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.552879  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  26.58 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  26.95 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  25.59 
 
 		 560 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  32.91 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>