211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0524 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 364 aa  742    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  53.47 
 
 		 276 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  52.65 
 
 		 280 aa  248  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  52.24 
 
 		 281 aa  248  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  52.24 
 
 		 281 aa  245  8e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  44.95 
 
 		 320 aa  233  5e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  45.49 
 
 		 287 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  44.94 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  43.75 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  43.98 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  44.31 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  44.44 
 
 		 257 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  34.21 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  34.45 
 
 		 259 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  32.35 
 
 		 510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  35.05 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  35.02 
 
 		 569 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  34.54 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  35.05 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  34.54 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  33.91 
 
 		 559 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  31.93 
 
 		 510 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  34.54 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  34.02 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  34.54 
 
 		 509 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 		 574 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  31.38 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 575 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 575 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  32.35 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  32.35 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  32.38 
 
 		 584 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  32.99 
 
 		 512 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  29.44 
 
 		 514 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  32.9 
 
 		 567 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  33.62 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  33.85 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  32.2 
 
 		 509 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  31.65 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  33.48 
 
 		 574 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  31.65 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  32.52 
 
 		 519 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  32.79 
 
 		 575 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  32.64 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  30.3 
 
 		 573 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  30.77 
 
 		 243 aa  96.7  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  34.21 
 
 		 519 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  32.89 
 
 		 562 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  34.55 
 
 		 528 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  34.03 
 
 		 519 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  30.52 
 
 		 484 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  29.63 
 
 		 262 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  31.17 
 
 		 504 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  33.79 
 
 		 520 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  30 
 
 		 247 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  34.03 
 
 		 562 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  33.51 
 
 		 514 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  33.85 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  30.77 
 
 		 250 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  33.18 
 
 		 281 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  31.12 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  32.12 
 
 		 570 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  33.06 
 
 		 497 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  32.77 
 
 		 280 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  35.33 
 
 		 505 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  31.94 
 
 		 563 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  29.63 
 
 		 521 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  29.63 
 
 		 521 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  37.5 
 
 		 494 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  30.96 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.31 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  30.17 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  29.74 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  30.99 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  37.5 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  32.39 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  31.46 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  32.96 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  30.37 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.32 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  26.85 
 
 		 550 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  31.65 
 
 		 535 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.94 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  25.31 
 
 		 248 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  27.2 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  28.12 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  29.63 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  47.3 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  28.37 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  30.17 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  27.13 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.63 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  29.51 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  23.74 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>