178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0799 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 242 aa  487  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  30.96 
 
 		 478 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 		 502 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  31.58 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  26.03 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  27.73 
 
 		 506 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28.7 
 
 		 498 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  26.42 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  28.98 
 
 		 301 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  31.56 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  29.57 
 
 		 502 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  33.04 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  30.4 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  27.76 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  28.74 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  29.26 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  30.43 
 
 		 501 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.69 
 
 		 512 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  29.36 
 
 		 512 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  26.91 
 
 		 550 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 507 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  29.26 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  25.32 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  25.32 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  29.3 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  32.59 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  25.93 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  26.29 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  32.59 
 
 		 505 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  27.24 
 
 		 519 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 503 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 		 504 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  29.44 
 
 		 559 aa  78.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  28.46 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  27.57 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  29.28 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  27.23 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  26.14 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  27.23 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  25.21 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  24.79 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  26.09 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  26.09 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  26.21 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  28 
 
 		 494 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  25.79 
 
 		 519 aa  75.9  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  25.3 
 
 		 491 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  27.31 
 
 		 489 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  29.54 
 
 		 500 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  25.1 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  28.81 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  47.3 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  26.59 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  28.12 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  25.97 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  28.4 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  25.31 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  29.75 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  29.69 
 
 		 508 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  26.32 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 		 492 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0798  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  28.97 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.31 
 
 		 499 aa  72.4  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 		 489 aa  72  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  29.96 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  25.91 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  27.73 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.39 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  25.29 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  25.29 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  29.91 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  25.74 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  25.79 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  24.41 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  28.26 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  27.59 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  24.36 
 
 		 510 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.19 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 504 aa  68.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  25.71 
 
 		 562 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  28.45 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 		 575 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  25.42 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  45.12 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  27.85 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  45.33 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  25.78 
 
 		 535 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  25.53 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.78 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>