275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0716 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
266 aa  526  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  38.14 
 
 
242 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  38.14 
 
 
242 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  35.48 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  32.54 
 
 
514 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  30.92 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  34.21 
 
 
364 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  30.74 
 
 
528 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  29.92 
 
 
512 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  30.45 
 
 
519 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  29.66 
 
 
509 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  30.33 
 
 
512 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  30.74 
 
 
519 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  31.56 
 
 
519 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  33.77 
 
 
235 aa  125  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  28.22 
 
 
500 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  28.22 
 
 
500 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  29.92 
 
 
512 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  30.93 
 
 
250 aa  123  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  30.8 
 
 
259 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 
488 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  31.15 
 
 
514 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.92 
 
 
510 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  30.52 
 
 
510 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  33.76 
 
 
224 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  29.05 
 
 
498 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  28.09 
 
 
507 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  28.09 
 
 
507 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  31.62 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  27.66 
 
 
506 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  37.93 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 
509 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 
509 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  28.22 
 
 
509 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  36.64 
 
 
281 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  29.63 
 
 
521 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  29.63 
 
 
521 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  36.64 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  28.97 
 
 
520 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  36.1 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  32.24 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  31.17 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  30.3 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  31.17 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  28.11 
 
 
504 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  31.2 
 
 
494 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  31.08 
 
 
584 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
461 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  30.96 
 
 
574 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  34.04 
 
 
258 aa  106  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  27.9 
 
 
286 aa  105  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  29.74 
 
 
362 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  33.62 
 
 
258 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  34.04 
 
 
258 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  35.24 
 
 
257 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  30.04 
 
 
402 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  31.03 
 
 
569 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.69 
 
 
565 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0716  KaiC  31.53 
 
 
208 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  29.68 
 
 
228 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  29.68 
 
 
236 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  31.48 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  29.11 
 
 
232 aa  99.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 
287 aa  99.4  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  29.58 
 
 
575 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  28.87 
 
 
573 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  31.14 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  30.54 
 
 
248 aa  96.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  31.42 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  29.66 
 
 
484 aa  95.5  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 
489 aa  95.5  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  29.41 
 
 
570 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  26.97 
 
 
467 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  33.19 
 
 
320 aa  93.2  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  31.19 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 
497 aa  92  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  28.51 
 
 
575 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  28.51 
 
 
575 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  28.81 
 
 
562 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.73 
 
 
560 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  28.51 
 
 
562 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 
344 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  30.14 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  28.69 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 
234 aa  89  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  28.51 
 
 
237 aa  89  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  29.06 
 
 
559 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  28.09 
 
 
567 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.09 
 
 
563 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  30.17 
 
 
482 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.45 
 
 
570 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  32.38 
 
 
497 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  31.28 
 
 
532 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  32.2 
 
 
237 aa  87  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.34 
 
 
459 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  30.8 
 
 
492 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  29.74 
 
 
574 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  30.63 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
498 aa  86.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  29.75 
 
 
494 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>