294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1291 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  65.85 
 
 
258 aa  326  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  64.63 
 
 
258 aa  325  6e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  64.63 
 
 
258 aa  321  9.000000000000001e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  67.98 
 
 
257 aa  318  7e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  51.88 
 
 
285 aa  250  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  45.49 
 
 
364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  40 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  41.99 
 
 
276 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  40.93 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  39.52 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  37.8 
 
 
281 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  33.6 
 
 
259 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  33.47 
 
 
514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  29.75 
 
 
509 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  32.07 
 
 
509 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  32.91 
 
 
509 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  33.2 
 
 
510 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  32.49 
 
 
498 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  34.53 
 
 
512 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  33.05 
 
 
519 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  32.91 
 
 
509 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  32.29 
 
 
488 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  32.77 
 
 
500 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  32.89 
 
 
500 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  32.49 
 
 
512 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  31.98 
 
 
519 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  31.82 
 
 
574 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  33.76 
 
 
575 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 
519 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  30.42 
 
 
569 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  33.76 
 
 
575 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  33.76 
 
 
567 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  34.35 
 
 
570 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  31.39 
 
 
232 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  33.78 
 
 
512 aa  99  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  32.43 
 
 
528 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  31.98 
 
 
510 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  31.78 
 
 
514 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  36.17 
 
 
562 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  30.89 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  31.98 
 
 
520 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  31.12 
 
 
574 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  36.17 
 
 
563 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  33.78 
 
 
565 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  32.62 
 
 
562 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  29.18 
 
 
229 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  34.98 
 
 
584 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  32.08 
 
 
573 aa  95.5  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  33.04 
 
 
570 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  30.52 
 
 
506 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.37 
 
 
242 aa  93.6  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.14 
 
 
575 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.37 
 
 
242 aa  93.6  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  31.53 
 
 
521 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  31.53 
 
 
521 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  33.19 
 
 
560 aa  92.4  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  29.64 
 
 
507 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  29.64 
 
 
507 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  29.86 
 
 
234 aa  85.5  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  28.3 
 
 
281 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.36 
 
 
559 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  29.8 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  29.39 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  29.11 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
497 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  27.43 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  28.5 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  28.28 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  27.18 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  25.97 
 
 
502 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  28.3 
 
 
402 aa  79  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  29.73 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  26.91 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  31.95 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  29.13 
 
 
498 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  29.38 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  26.72 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  27.63 
 
 
467 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  27.07 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  27.57 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  26.79 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  43.42 
 
 
496 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  26.17 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  25.85 
 
 
532 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  27.31 
 
 
505 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  28.37 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  46.58 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  26.14 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  44.44 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  26.87 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  28.93 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  24.55 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  23.17 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>