More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0219 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  91.76 
 
 		 271 aa  519  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  89.51 
 
 		 277 aa  509  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  89.14 
 
 		 267 aa  508  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  56.6 
 
 		 295 aa  308  8e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  38.64 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  37.64 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  29.06 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  29.06 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  31.01 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  32.39 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  29.6 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  32.66 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  32.4 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  30.89 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  27.76 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  27.07 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  24.91 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  26.69 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  27.6 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  25.94 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  26.77 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  25.28 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  25.98 
 
 		 488 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  39.24 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  26.1 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  27.1 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  25.97 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  36.84 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  26.38 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  25.94 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  25.27 
 
 		 514 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  23.83 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0714  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  25 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  38.83 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  25.37 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  24.14 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  25.98 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  25.59 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  26.17 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  24.8 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.39 
 
 		 574 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  25.29 
 
 		 519 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  36.54 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  25.38 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  26.57 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  25.29 
 
 		 509 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  23.55 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  26.89 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  26.94 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  26.89 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  23.94 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  38.83 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  26.25 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  23.88 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  36.54 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  23.23 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  35.71 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  25.48 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  24.62 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  25.9 
 
 		 584 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  39.81 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.81 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  38.55 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  25.79 
 
 		 494 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  41.89 
 
 		 499 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  25.99 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  32.93 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  34.21 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.69 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  43.48 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  25.38 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  22.79 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  35.37 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  26.57 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  33.33 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  25.67 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  30.63 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  39.44 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  23.83 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  26.72 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  32.69 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  32.67 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  24.59 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  30.23 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  29.48 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  26.1 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.14 
 
 		 570 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  31.11 
 
 		 459 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  23.55 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  35.62 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  25.37 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  32.67 
 
 		 474 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>