220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1661 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
344 aa  687    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  66.12 
 
 
402 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  56.32 
 
 
362 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  70.46 
 
 
472 aa  344  1e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  43.23 
 
 
234 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  41.48 
 
 
232 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  40.79 
 
 
229 aa  198  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  41.13 
 
 
237 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  31.2 
 
 
509 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  31.2 
 
 
509 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  32.05 
 
 
509 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 
498 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  32.49 
 
 
488 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  31.2 
 
 
512 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  31.49 
 
 
512 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 
500 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  33.47 
 
 
521 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 
500 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  33.47 
 
 
521 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  34.51 
 
 
241 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  32.67 
 
 
528 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  30.15 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  31.58 
 
 
519 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  32.74 
 
 
504 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.91 
 
 
512 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  31.52 
 
 
519 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  30.25 
 
 
514 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  33.48 
 
 
509 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  32.63 
 
 
520 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  27.83 
 
 
506 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  31.76 
 
 
514 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  32.77 
 
 
510 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  31.76 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  32.92 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  32.5 
 
 
250 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  28.26 
 
 
507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  28.26 
 
 
507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  29.54 
 
 
242 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  29.54 
 
 
242 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  31 
 
 
242 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  29.71 
 
 
235 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 
467 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  30.97 
 
 
241 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  31.36 
 
 
280 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  32.17 
 
 
559 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  30.51 
 
 
283 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  29.61 
 
 
496 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  29.17 
 
 
293 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  30.36 
 
 
262 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  29.27 
 
 
247 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  29.66 
 
 
281 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.51 
 
 
497 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  29.96 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28.15 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  28.27 
 
 
285 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  29.71 
 
 
569 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  32.14 
 
 
560 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  32.14 
 
 
575 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  31.56 
 
 
570 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  30.87 
 
 
570 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  30.17 
 
 
565 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  31.58 
 
 
484 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  29.44 
 
 
567 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 
497 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  30.43 
 
 
224 aa  92.8  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  29.28 
 
 
518 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  29.1 
 
 
575 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  28.69 
 
 
575 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.58 
 
 
459 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  25.65 
 
 
532 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  30.28 
 
 
289 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  30.36 
 
 
584 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.87 
 
 
562 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  28.09 
 
 
236 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 
265 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.57 
 
 
505 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 
266 aa  89.7  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  31.58 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.49 
 
 
497 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  30.22 
 
 
574 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  25.1 
 
 
301 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  26.18 
 
 
496 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  29.46 
 
 
562 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.39 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  28.1 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  30.92 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  29.02 
 
 
563 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  29.35 
 
 
505 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  26.41 
 
 
574 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  28.45 
 
 
573 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  25.6 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  28.63 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  25.11 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  25.74 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  30.56 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  25.79 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  25.74 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>