More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2554 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  65.83 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  67.08 
 
 		 241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  31 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  30.04 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  29.82 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  29.78 
 
 		 500 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  30.26 
 
 		 512 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  30.22 
 
 		 500 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 		 498 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  32.02 
 
 		 519 aa  99  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 		 509 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  29.07 
 
 		 509 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  29.96 
 
 		 528 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  29.07 
 
 		 509 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  30.13 
 
 		 519 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  32.78 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  30.96 
 
 		 402 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.31 
 
 		 488 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  30.36 
 
 		 565 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  30.34 
 
 		 472 aa  92  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 		 521 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 		 521 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  27.95 
 
 		 514 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  31.14 
 
 		 574 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  32.37 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  29.33 
 
 		 494 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  30.25 
 
 		 280 aa  89  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  32.91 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  26.43 
 
 		 512 aa  88.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  30.64 
 
 		 510 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  29.96 
 
 		 510 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  31.33 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  27.75 
 
 		 520 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  25.99 
 
 		 512 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  29.96 
 
 		 560 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  31.54 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  29.46 
 
 		 559 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  26.64 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.82 
 
 		 573 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  30.34 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  30.87 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  30.13 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  32.07 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  30.84 
 
 		 575 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  30.22 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  29.65 
 
 		 570 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  28.21 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  25.75 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.2 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  29.65 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  28.32 
 
 		 584 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  26.16 
 
 		 482 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  28.57 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.21 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  26.67 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  28.09 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  29.65 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  29.65 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  29.2 
 
 		 570 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.88 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  27.06 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  27.34 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 504 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 494 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  27.43 
 
 		 484 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  31.56 
 
 		 518 aa  75.5  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  29.82 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  26.92 
 
 		 492 aa  75.1  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.31 
 
 		 496 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  27.83 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.57 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  27.56 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.16 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  29.46 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  26.25 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  30.93 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  30.47 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  26.52 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.88 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  28.82 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  26.67 
 
 		 569 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  28.82 
 
 		 258 aa  72  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 497 aa  72  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.94 
 
 		 498 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  27.35 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  28.07 
 
 		 228 aa  72  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>