222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1788 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  85.21 
 
 		 281 aa  507  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  84.51 
 
 		 293 aa  499  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  84.1 
 
 		 283 aa  498  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  75.7 
 
 		 286 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  72.27 
 
 		 280 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  67.38 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  67.38 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  65.98 
 
 		 250 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  36.12 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  37.89 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  33.9 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  32.54 
 
 		 528 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  32.27 
 
 		 519 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  31.17 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  31.75 
 
 		 519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  32.75 
 
 		 514 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  31.91 
 
 		 514 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  31.54 
 
 		 519 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  29.11 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  32.94 
 
 		 520 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  31.58 
 
 		 506 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  30.7 
 
 		 507 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  30.7 
 
 		 507 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  32.77 
 
 		 521 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  32.77 
 
 		 521 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  31.09 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  31.51 
 
 		 229 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.57 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  31.44 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  28.46 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  32 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  28.27 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  32.66 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  33.6 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  32.26 
 
 		 267 aa  99  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  31.36 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.37 
 
 		 512 aa  96.3  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  31.56 
 
 		 584 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  29.37 
 
 		 512 aa  95.9  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  29.51 
 
 		 565 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  29.76 
 
 		 509 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  31 
 
 		 509 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  27.98 
 
 		 472 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  29.76 
 
 		 488 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  29.08 
 
 		 498 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  29.37 
 
 		 509 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  30.04 
 
 		 500 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  29.34 
 
 		 235 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  29.2 
 
 		 512 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  29.03 
 
 		 560 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  29.76 
 
 		 509 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  29.64 
 
 		 500 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  30.58 
 
 		 567 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  28.27 
 
 		 504 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  28.92 
 
 		 562 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.76 
 
 		 575 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  28.25 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  30.43 
 
 		 563 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.11 
 
 		 573 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  28.45 
 
 		 236 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.63 
 
 		 562 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  31.54 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  29.8 
 
 		 569 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.45 
 
 		 559 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  28.69 
 
 		 482 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  28.38 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  31.78 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  23.21 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  30.21 
 
 		 570 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  26.81 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  30.99 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  28.81 
 
 		 570 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.85 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  27.62 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  29.66 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  29.34 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  30.51 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  29.34 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  29.22 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  26.47 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  27.76 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  31.62 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.88 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  27.69 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  29.53 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  27.9 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  30.32 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  28.87 
 
 		 497 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  26.17 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  28.27 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  26.72 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>