More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0226 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  91.01 
 
 		 271 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  90.26 
 
 		 277 aa  508  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  89.14 
 
 		 267 aa  508  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  55.6 
 
 		 295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  39.25 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  38.02 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.6 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.6 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  30.35 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  32.39 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  32.26 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  31.98 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  31.98 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  28.4 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  27.99 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  25.6 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  26.67 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  26.97 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  25.47 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  25.5 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  42.11 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  37.97 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  26.14 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  25.86 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  24.91 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  24.15 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  28.12 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  23.28 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  24.71 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  24.42 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  24.71 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  25.29 
 
 		 535 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  27.2 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  24.31 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0714  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  27.54 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  25.18 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  40.51 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  35.44 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  41.03 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.88 
 
 		 574 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  24.45 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  39.81 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  31.87 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  40.74 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  36.61 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  26.54 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  38.46 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  21.64 
 
 		 514 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  38.55 
 
 		 229 aa  62  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  47.14 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  49.18 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  24.73 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  38.83 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  34.65 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  40.74 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  42.31 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  24.62 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1922  DNA repair protein RadA  33.33 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000667281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  23.7 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  23.72 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  22.63 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  31.88 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  35.64 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  34.62 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  36.45 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  44.12 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  33.01 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  33.01 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  23.14 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  34.29 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  41.03 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  39.24 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  32.3 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  25.41 
 
 		 517 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  39.24 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  35.37 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  31.11 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  40.54 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2176  DNA repair protein RadA  40.79 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  34.55 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  37.14 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  25.76 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  26.3 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.3 
 
 		 453 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4000  DNA repair protein RadA  35.29 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  39.44 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  34.62 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  31.85 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1613  putative circadian clock protein, KaiC  25.42 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  33.9 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  25.49 
 
 		 573 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  33.01 
 
 		 452 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  40.85 
 
 		 452 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>