77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0949 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0701  putative circadian clock protein, KaiC  50.53 
 
 		 303 aa  301  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0532  putative circadian clock protein, KaiC  52.19 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0072  putative circadian clock protein, KaiC  53.03 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1463  putative circadian clock protein, KaiC  50 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1613  putative circadian clock protein, KaiC  49.09 
 
 		 312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1964  putative circadian clock protein, KaiC  46.38 
 
 		 281 aa  265  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.65 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.65 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  29.24 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  30.51 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  27.39 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  30.64 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  30.08 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  29 
 
 		 520 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  28.21 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  28.34 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  26.84 
 
 		 514 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  28.51 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 528 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  29.24 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  28.69 
 
 		 521 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  28.69 
 
 		 521 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  24.17 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  27.35 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  26.27 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  26.25 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  26.5 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  27.85 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  27.22 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  26.2 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  27.22 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  27.85 
 
 		 498 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  27.85 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  24.69 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  25.32 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.22 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  27.22 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  25.56 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  25.62 
 
 		 565 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  27.22 
 
 		 512 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 569 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  23.28 
 
 		 574 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  24.44 
 
 		 574 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  31.45 
 
 		 509 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  25.75 
 
 		 567 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.46 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  23.62 
 
 		 575 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  23.87 
 
 		 506 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  25.94 
 
 		 362 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  26.58 
 
 		 488 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  25.15 
 
 		 575 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  24.37 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  23.95 
 
 		 560 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  25.86 
 
 		 573 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  24.79 
 
 		 584 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  24.14 
 
 		 575 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  23.93 
 
 		 457 aa  47.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  23.15 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  22.8 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  26.25 
 
 		 446 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  24.36 
 
 		 464 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  25.82 
 
 		 494 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.97 
 
 		 494 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  25.85 
 
 		 450 aa  44.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0372  AAA ATPase  23.55 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  23.93 
 
 		 467 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  23.93 
 
 		 467 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  24.8 
 
 		 559 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  21.94 
 
 		 510 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  23.25 
 
 		 518 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  25.79 
 
 		 450 aa  42.7  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  21.94 
 
 		 510 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  23.68 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>