More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0305 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  92.67 
 
 		 450 aa  857    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 450 aa  914    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  63.76 
 
 		 450 aa  598  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  50.82 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  50.81 
 
 		 474 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1207  DNA repair protein RadA  52.11 
 
 		 458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0415  DNA repair protein RadA  51.06 
 
 		 470 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  50.94 
 
 		 460 aa  438  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  52.26 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  47.31 
 
 		 455 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  50.95 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  50.83 
 
 		 482 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  48.27 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3499  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 486 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  50.24 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  50.24 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  48.7 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  49.19 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  49.76 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  46.97 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2402  DNA repair protein RadA  47.19 
 
 		 489 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  49.29 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  46.73 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  49.29 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  49.41 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  44.67 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.78 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0403  DNA repair protein RadA  47.23 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1850  DNA repair protein RadA  46.43 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0985  DNA repair protein RadA  48.64 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3941  DNA repair protein RadA  47.42 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  44.79 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  45.22 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  44.77 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  47.1 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  48 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  46.17 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.23 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  48.11 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  46.95 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  46.84 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  42.86 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  44.03 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.71 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  42.64 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  42.73 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  45.22 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  43.02 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  42.16 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  43.89 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  41.98 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  43.02 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  41.24 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  42.92 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  45.75 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  43.88 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  46.35 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  46.28 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  44.12 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  41.23 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  44.06 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>