47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1964 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1964  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1463  putative circadian clock protein, KaiC  55.21 
 
 		 296 aa  292  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0701  putative circadian clock protein, KaiC  51.27 
 
 		 303 aa  285  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0072  putative circadian clock protein, KaiC  51.71 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  46.38 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0532  putative circadian clock protein, KaiC  50.54 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1613  putative circadian clock protein, KaiC  44.09 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  26.92 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  26.92 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  25.76 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  27.45 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  27.24 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  26.67 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  27.08 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  24.24 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  24.36 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  25.88 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.77 
 
 		 520 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  24.62 
 
 		 559 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 528 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  25.63 
 
 		 514 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  25.63 
 
 		 519 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  25.25 
 
 		 521 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  25.25 
 
 		 521 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  29.77 
 
 		 446 aa  46.6  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  23.23 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  23.23 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  21.65 
 
 		 507 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  23.33 
 
 		 506 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  24.22 
 
 		 574 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  21.65 
 
 		 507 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  23.83 
 
 		 499 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  25.67 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  24.55 
 
 		 575 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  25.37 
 
 		 584 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  25.27 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  25.34 
 
 		 573 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  24.81 
 
 		 575 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  24.54 
 
 		 562 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0107  replicative DNA helicase  22.56 
 
 		 442 aa  42.7  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.598897  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  25.67 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  35.4 
 
 		 505 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  24.73 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  24.44 
 
 		 446 aa  42.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  23.63 
 
 		 482 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>