More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0107 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0107  replicative DNA helicase  100 
 
 
442 aa  892    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.598897  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl084  DNA replication priming helicase  50.9 
 
 
448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  42.19 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  41.8 
 
 
459 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  40.58 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  40.58 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  40.58 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  41.22 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  40.65 
 
 
449 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  41.9 
 
 
446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  40.18 
 
 
449 aa  309  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  43.02 
 
 
454 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  39.68 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  41.86 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  42.33 
 
 
454 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  41.67 
 
 
451 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  38.19 
 
 
441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
453 aa  302  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
453 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
453 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
453 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
453 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
453 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  40.7 
 
 
453 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  39.09 
 
 
444 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  40.47 
 
 
449 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  40.47 
 
 
453 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  38.81 
 
 
439 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  39.86 
 
 
449 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  39.4 
 
 
460 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  37.3 
 
 
456 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  39.77 
 
 
513 aa  296  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
470 aa  295  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.3 
 
 
456 aa  295  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
453 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  39.63 
 
 
445 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  37.24 
 
 
456 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  37.04 
 
 
445 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  39.14 
 
 
458 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  38.81 
 
 
514 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  38.8 
 
 
447 aa  290  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  38.07 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  38.07 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  38.76 
 
 
525 aa  289  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  39.58 
 
 
512 aa  289  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  36.72 
 
 
481 aa  289  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  39.31 
 
 
476 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  38.52 
 
 
444 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  38.67 
 
 
522 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  38.94 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  40.78 
 
 
455 aa  286  4e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  37.12 
 
 
481 aa  285  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  37.9 
 
 
443 aa  285  9e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  39.04 
 
 
469 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  37.67 
 
 
453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  37.67 
 
 
465 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  38.85 
 
 
476 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  39.36 
 
 
529 aa  283  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  37.44 
 
 
473 aa  283  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  39.22 
 
 
509 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  37.35 
 
 
440 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  36.36 
 
 
442 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  38.75 
 
 
443 aa  282  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  37.47 
 
 
460 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  37.84 
 
 
460 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  38.07 
 
 
461 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  37.79 
 
 
539 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  38.11 
 
 
471 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  38.11 
 
 
471 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  40.78 
 
 
446 aa  279  7e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  37.59 
 
 
444 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  48.06 
 
 
318 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  37.82 
 
 
451 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  39.27 
 
 
469 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  37.5 
 
 
447 aa  276  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  38.52 
 
 
446 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  37.27 
 
 
456 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
456 aa  275  9e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  36.43 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  37.41 
 
 
528 aa  274  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  38.64 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  35.73 
 
 
508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  38.02 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0535  replicative DNA helicase  38.19 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  35.63 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  39.4 
 
 
450 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  36.81 
 
 
448 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  37.12 
 
 
456 aa  272  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  35.35 
 
 
460 aa  272  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  35.58 
 
 
461 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  37.14 
 
 
471 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  36.55 
 
 
458 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  36.99 
 
 
524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  37.76 
 
 
463 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  37.81 
 
 
473 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  34.95 
 
 
457 aa  269  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  37.41 
 
 
470 aa  269  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
468 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
468 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  38.36 
 
 
468 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>