More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0535 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0535  replicative DNA helicase  100 
 
 
443 aa  902    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.67 
 
 
442 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  46.1 
 
 
446 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  44.7 
 
 
448 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  46.21 
 
 
445 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  44.29 
 
 
447 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  44.37 
 
 
459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  42.96 
 
 
441 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  41.24 
 
 
439 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  41.24 
 
 
444 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  42.17 
 
 
454 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  40.77 
 
 
449 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  40.77 
 
 
453 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  41 
 
 
453 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  41.65 
 
 
442 aa  352  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  42.4 
 
 
454 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  42 
 
 
444 aa  348  9e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  40.69 
 
 
442 aa  346  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  41.47 
 
 
443 aa  345  8.999999999999999e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  42.39 
 
 
444 aa  342  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  39.09 
 
 
453 aa  335  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  42.42 
 
 
441 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  40.09 
 
 
444 aa  333  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  40.59 
 
 
473 aa  332  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  39.91 
 
 
446 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  40.05 
 
 
476 aa  329  7e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  40.05 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  39.23 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  39.59 
 
 
446 aa  325  9e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  40.05 
 
 
472 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  39.4 
 
 
444 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  40.6 
 
 
450 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  40.41 
 
 
447 aa  323  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  39.08 
 
 
476 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  38.76 
 
 
508 aa  322  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  39.03 
 
 
460 aa  322  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  39.59 
 
 
469 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  39.1 
 
 
463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  39.23 
 
 
472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  39.23 
 
 
472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  36.53 
 
 
466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  36.53 
 
 
466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  39.59 
 
 
464 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  40.46 
 
 
443 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  39.59 
 
 
464 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  37.05 
 
 
457 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  37.05 
 
 
457 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  40 
 
 
449 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  36.53 
 
 
466 aa  318  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  37.33 
 
 
462 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  39.14 
 
 
473 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  37.93 
 
 
452 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  38.44 
 
 
481 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  40.5 
 
 
445 aa  317  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  37.86 
 
 
478 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  39.41 
 
 
465 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  37.56 
 
 
481 aa  316  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  38.24 
 
 
477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  38.62 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  37.7 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  38.5 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  37.78 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  37.84 
 
 
461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  39.27 
 
 
470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  38.62 
 
 
456 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  39.69 
 
 
513 aa  313  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  39.91 
 
 
509 aa  312  9e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  37.41 
 
 
450 aa  312  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  38.5 
 
 
468 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  37.58 
 
 
455 aa  310  4e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  39.4 
 
 
450 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  38.5 
 
 
451 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  36.88 
 
 
464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  36.3 
 
 
458 aa  308  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  38.74 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  38.39 
 
 
449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  39.91 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  37.78 
 
 
465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  37.33 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  37.56 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  41.04 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  36.7 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  37.78 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  37.56 
 
 
465 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  40.04 
 
 
529 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  37.33 
 
 
464 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  37.78 
 
 
453 aa  306  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  37.78 
 
 
449 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  39.32 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  37.33 
 
 
465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  37.98 
 
 
456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3475  replicative DNA helicase  36.32 
 
 
497 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>