76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0532 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0532  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0701  putative circadian clock protein, KaiC  55.09 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0072  putative circadian clock protein, KaiC  56.16 
 
 		 295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1463  putative circadian clock protein, KaiC  53.68 
 
 		 296 aa  325  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  52.19 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1613  putative circadian clock protein, KaiC  47.55 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1964  putative circadian clock protein, KaiC  50.54 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  26.01 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  26.01 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  26.72 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  25.09 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  27.88 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  26.34 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  25.28 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  25.78 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  26.34 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  24.64 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  23.78 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  26.7 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  26.7 
 
 		 574 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  25.25 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  25.25 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  29.19 
 
 		 570 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  23.91 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.49 
 
 		 570 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.92 
 
 		 520 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  23.61 
 
 		 509 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  27.17 
 
 		 562 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  22.73 
 
 		 509 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  23.18 
 
 		 498 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  25.64 
 
 		 567 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  22.22 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  22.75 
 
 		 509 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  25.43 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 		 575 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  24.34 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  22.34 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  25.64 
 
 		 562 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  26.04 
 
 		 512 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  24.69 
 
 		 467 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  24.86 
 
 		 500 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24.63 
 
 		 569 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.63 
 
 		 563 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  25.23 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  26.09 
 
 		 494 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  27.32 
 
 		 514 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  27.27 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  27.27 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  22.49 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  27.32 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  26.46 
 
 		 519 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.15 
 
 		 504 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  23.21 
 
 		 574 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  26.4 
 
 		 584 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  25.29 
 
 		 512 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  24.48 
 
 		 514 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  25.71 
 
 		 512 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  27.66 
 
 		 528 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  27.14 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  23.81 
 
 		 510 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  23.74 
 
 		 519 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  24.57 
 
 		 488 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  29.41 
 
 		 560 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  30.73 
 
 		 498 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  23.69 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  23.81 
 
 		 510 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  23.44 
 
 		 573 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  27.61 
 
 		 509 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  24.18 
 
 		 518 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  28.33 
 
 		 362 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  25.32 
 
 		 506 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  24.03 
 
 		 507 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  24.03 
 
 		 507 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  23.81 
 
 		 229 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>