215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1600 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  93.59 
 
 
281 aa  541  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  84.51 
 
 
285 aa  499  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  82.98 
 
 
283 aa  498  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  75 
 
 
286 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  72.66 
 
 
280 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  64.5 
 
 
242 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  64.5 
 
 
242 aa  334  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  64.46 
 
 
250 aa  332  5e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  36.12 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  33.05 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  32.48 
 
 
259 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  30.83 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  34.85 
 
 
514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  34.04 
 
 
510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  32.34 
 
 
229 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  32.33 
 
 
507 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  32.46 
 
 
506 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  32.33 
 
 
507 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  32.77 
 
 
528 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  33.04 
 
 
510 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  32.07 
 
 
362 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  32.64 
 
 
514 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  30.8 
 
 
519 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  32.35 
 
 
519 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  32.39 
 
 
267 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  30.35 
 
 
267 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  29.17 
 
 
344 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  32.79 
 
 
277 aa  102  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
271 aa  102  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  30.92 
 
 
519 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  31.12 
 
 
520 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  31.44 
 
 
509 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  33.61 
 
 
584 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  30.93 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  30.67 
 
 
521 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  30.67 
 
 
521 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.68 
 
 
559 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  30.83 
 
 
482 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  31.84 
 
 
562 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 
512 aa  89.7  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.15 
 
 
575 aa  89  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  23.4 
 
 
459 aa  89  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  31.56 
 
 
562 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  32.91 
 
 
242 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  28.98 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  28.8 
 
 
496 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 
512 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  27.97 
 
 
236 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 
237 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.36 
 
 
565 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  29.29 
 
 
235 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 
509 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  26.05 
 
 
224 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  28.51 
 
 
500 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  30.29 
 
 
569 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  27.98 
 
 
472 aa  86.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 
509 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 
498 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.96 
 
 
573 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  28.15 
 
 
500 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  31.15 
 
 
567 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  28.45 
 
 
243 aa  85.5  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30.24 
 
 
570 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  31.23 
 
 
563 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  30.74 
 
 
575 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  28.63 
 
 
560 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 
512 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
518 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 
488 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  30.74 
 
 
575 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
498 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  30.99 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  31.46 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  26.12 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  31.06 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.92 
 
 
574 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  29.24 
 
 
501 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  34.01 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  27.03 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  30.83 
 
 
505 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  28.27 
 
 
234 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  29.05 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  27.03 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  30.49 
 
 
492 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  29.96 
 
 
497 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  26.38 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.17 
 
 
532 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  26.79 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  26.13 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  26.58 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 
241 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  28.15 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>