More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2542 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  73.19 
 
 		 563 aa  845    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  75.22 
 
 		 570 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  73.25 
 
 		 570 aa  804    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  100 
 
 		 560 aa  1129    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  72.64 
 
 		 562 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  57.17 
 
 		 584 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  56.27 
 
 		 562 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  58.88 
 
 		 567 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  58.9 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  58.9 
 
 		 575 aa  598  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  54.28 
 
 		 574 aa  595  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  53.93 
 
 		 569 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  52.25 
 
 		 575 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  52.05 
 
 		 573 aa  580  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  53.89 
 
 		 574 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  52.34 
 
 		 559 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  51.24 
 
 		 565 aa  502  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  38.51 
 
 		 521 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  38.51 
 
 		 521 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  38.72 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  40.48 
 
 		 484 aa  336  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  39.29 
 
 		 509 aa  333  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  38.02 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  34.06 
 
 		 550 aa  329  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  37.62 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  36.76 
 
 		 528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  36.59 
 
 		 519 aa  327  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  36.93 
 
 		 519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  38.19 
 
 		 509 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  39.48 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  36.67 
 
 		 519 aa  326  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  38.84 
 
 		 514 aa  325  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  39.26 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  38.2 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  36.85 
 
 		 512 aa  320  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  38.61 
 
 		 488 aa  319  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  37.17 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  36.96 
 
 		 500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  37.91 
 
 		 510 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  37.5 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  37.45 
 
 		 504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  36.59 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  36.36 
 
 		 506 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  35.96 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  35.96 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  32.09 
 
 		 474 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  29.23 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  28.77 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  27.35 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  27.62 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  28.06 
 
 		 501 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  27.74 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  29.62 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  27.59 
 
 		 518 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  26.89 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28.16 
 
 		 498 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  26.26 
 
 		 496 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  28.36 
 
 		 496 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  27.64 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  27.25 
 
 		 500 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  28.39 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  25.46 
 
 		 535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 		 502 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  26.73 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  28.51 
 
 		 482 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  27.18 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  32.63 
 
 		 259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 497 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 503 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 461 aa  127  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  25.41 
 
 		 532 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.52 
 
 		 481 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 503 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  27.72 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.91 
 
 		 494 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  26.13 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  27.29 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  25.96 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  27.74 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  26.51 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 507 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  27.76 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  26.7 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  31.47 
 
 		 250 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  34.22 
 
 		 362 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  26.48 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  26.95 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4235  ATPase-like protein  50 
 
 		 171 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147288 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.12 
 
 		 242 aa  106  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.12 
 
 		 242 aa  106  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  32.61 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  24.9 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>