More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2653 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  83.3 
 
 		 494 aa  845    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  84.15 
 
 		 494 aa  851    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  100 
 
 		 505 aa  1019    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  72.73 
 
 		 503 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  72.58 
 
 		 503 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  72.91 
 
 		 500 aa  738    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  53.99 
 
 		 502 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  54.38 
 
 		 501 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  54.41 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  52.75 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  53.72 
 
 		 489 aa  510  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  51.02 
 
 		 496 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  51.23 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  51.24 
 
 		 532 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  52.52 
 
 		 501 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.1 
 
 		 498 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  52.78 
 
 		 496 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.91 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  50.94 
 
 		 520 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  51.04 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  50.94 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  50.21 
 
 		 506 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  51.15 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  51.74 
 
 		 497 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  47.94 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  47.93 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  47.84 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  47.28 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  42.24 
 
 		 481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.34 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  42.09 
 
 		 480 aa  345  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  33.89 
 
 		 482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  35.48 
 
 		 478 aa  303  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  33.96 
 
 		 499 aa  293  5e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  33.2 
 
 		 535 aa  293  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  34.66 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  31.97 
 
 		 492 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  34.95 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  33.26 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  31.16 
 
 		 492 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  32.37 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  29.33 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.5 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  29.28 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  27.35 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  29.18 
 
 		 528 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  27.64 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  27.64 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  30.35 
 
 		 504 aa  177  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.2 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  29.88 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  28.79 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  27.58 
 
 		 509 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  27.81 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  27.4 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  27.18 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.18 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  27.2 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  27.76 
 
 		 520 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  27.81 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  28.92 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  27.22 
 
 		 519 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  26.58 
 
 		 512 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  27.61 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  26.98 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  29.65 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  27.14 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  27.14 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  29.07 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  27.02 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  27.62 
 
 		 514 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  28.75 
 
 		 575 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  26.15 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  28.6 
 
 		 575 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  28.4 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  28.11 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.74 
 
 		 562 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.77 
 
 		 574 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  29.12 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  28.72 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  27.84 
 
 		 567 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.11 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.87 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.6 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  26.92 
 
 		 574 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  25.5 
 
 		 559 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.11 
 
 		 570 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  26.18 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  28.27 
 
 		 569 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.78 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  28.05 
 
 		 570 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25.1 
 
 		 550 aa  116  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>