More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3032 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
483 aa  966    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  47.68 
 
 
535 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  48.01 
 
 
482 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  49.26 
 
 
478 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  46.47 
 
 
499 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  41.74 
 
 
492 aa  355  7.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  42.58 
 
 
489 aa  347  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  41.49 
 
 
492 aa  346  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  37.74 
 
 
482 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  37.4 
 
 
496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.53 
 
 
503 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 
504 aa  295  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 
504 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 
500 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  37.11 
 
 
501 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  38.14 
 
 
501 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  35.79 
 
 
494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  38.03 
 
 
520 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 
520 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  36.83 
 
 
502 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  36.76 
 
 
508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  35.52 
 
 
494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 
503 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 
498 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
502 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  37.09 
 
 
492 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  38.35 
 
 
498 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
507 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 
489 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  36.82 
 
 
506 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  37.39 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  34.95 
 
 
505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  36.9 
 
 
497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  34.03 
 
 
532 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  37.94 
 
 
496 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  36.27 
 
 
505 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
497 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  29.87 
 
 
481 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
480 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  29.74 
 
 
480 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  29.46 
 
 
565 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  26.36 
 
 
509 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  26.21 
 
 
509 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  25.81 
 
 
512 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  26.41 
 
 
509 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  26.07 
 
 
498 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  26.63 
 
 
500 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  26.12 
 
 
488 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  25.2 
 
 
512 aa  166  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  28.3 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  25.2 
 
 
528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  25.46 
 
 
512 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  26.02 
 
 
500 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  26.63 
 
 
510 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  30.57 
 
 
518 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  26.91 
 
 
504 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  26.33 
 
 
510 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  25.73 
 
 
507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  25.73 
 
 
507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  25.56 
 
 
519 aa  157  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  25.93 
 
 
506 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  27.31 
 
 
514 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  25.4 
 
 
521 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  25.4 
 
 
521 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.62 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  24.69 
 
 
520 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
481 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  27.39 
 
 
481 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  28.37 
 
 
575 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.57 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  24.7 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.76 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  23.94 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.67 
 
 
574 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  24.5 
 
 
519 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  25.77 
 
 
559 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  26.28 
 
 
454 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  26.43 
 
 
574 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  28.36 
 
 
491 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24.9 
 
 
569 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 
491 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  25.97 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  25.88 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  30.63 
 
 
494 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  25.21 
 
 
570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  25.51 
 
 
570 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5173  non-specific serine/threonine protein kinase  27.77 
 
 
501 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  26.39 
 
 
567 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  24.63 
 
 
584 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  26.52 
 
 
474 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  24.95 
 
 
562 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  24.69 
 
 
575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  24.69 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.7 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>