273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0348 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  85.08 
 
 
521 aa  887    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  75.92 
 
 
509 aa  788    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  79.01 
 
 
500 aa  806    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  85 
 
 
519 aa  889    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  83.86 
 
 
520 aa  885    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  79.12 
 
 
512 aa  833    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  78.71 
 
 
512 aa  827    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  76.02 
 
 
498 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  83.77 
 
 
519 aa  880    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  85.89 
 
 
519 aa  895    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  85.08 
 
 
521 aa  887    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  86.41 
 
 
514 aa  887    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  100 
 
 
528 aa  1075    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  75.51 
 
 
509 aa  784    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  76.33 
 
 
509 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  78.6 
 
 
500 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  78.03 
 
 
488 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  78.07 
 
 
512 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  55.33 
 
 
510 aa  568  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  55.89 
 
 
509 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  55.33 
 
 
510 aa  565  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  55.65 
 
 
507 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  55.65 
 
 
507 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  55.65 
 
 
506 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  54.2 
 
 
514 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  53.44 
 
 
504 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  38.35 
 
 
584 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  36.9 
 
 
562 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  38.67 
 
 
573 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  36.63 
 
 
563 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  36.76 
 
 
560 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  37.23 
 
 
574 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  38.87 
 
 
569 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  37.92 
 
 
575 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  37.2 
 
 
570 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  36.99 
 
 
570 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  38.8 
 
 
567 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  37.89 
 
 
574 aa  312  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  37.74 
 
 
559 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  37.5 
 
 
562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  37.27 
 
 
575 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  37.27 
 
 
575 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  36.92 
 
 
474 aa  289  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  36.81 
 
 
565 aa  286  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  31.21 
 
 
484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  30.47 
 
 
550 aa  203  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  27.14 
 
 
535 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  29.76 
 
 
492 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  40.76 
 
 
259 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  29.22 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  29.01 
 
 
494 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  29.18 
 
 
505 aa  180  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.4 
 
 
478 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  29.02 
 
 
492 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.54 
 
 
498 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.85 
 
 
499 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
498 aa  173  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  26.88 
 
 
482 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  27.05 
 
 
501 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.85 
 
 
532 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.74 
 
 
496 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  27.46 
 
 
496 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  27.55 
 
 
489 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.77 
 
 
497 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  28.63 
 
 
518 aa  166  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.2 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  26.2 
 
 
502 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 
504 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  28.87 
 
 
467 aa  160  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  27.94 
 
 
481 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  27.42 
 
 
508 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 
481 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 
504 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
461 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  27.6 
 
 
497 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  27.37 
 
 
505 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
481 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  26.03 
 
 
501 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  28.54 
 
 
494 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  26.07 
 
 
497 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  26.02 
 
 
454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
502 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  26.64 
 
 
506 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 
463 aa  145  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 
503 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  28.27 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  26.77 
 
 
520 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 
520 aa  140  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.46 
 
 
459 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.91 
 
 
482 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
507 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  26.53 
 
 
505 aa  136  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  35.15 
 
 
242 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  35.15 
 
 
242 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  33.48 
 
 
229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  28.24 
 
 
480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>