More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1116 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  100 
 
 		 550 aa  1115    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  37.45 
 
 		 484 aa  342  7e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  37.91 
 
 		 569 aa  340  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  35.99 
 
 		 559 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  36.19 
 
 		 574 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  34.66 
 
 		 574 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  34.06 
 
 		 560 aa  329  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  36.55 
 
 		 573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  34.72 
 
 		 563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  34.98 
 
 		 562 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  34.03 
 
 		 584 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  33.87 
 
 		 562 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  34.44 
 
 		 570 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  33.53 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  33.95 
 
 		 575 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  33.4 
 
 		 575 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  33.4 
 
 		 575 aa  293  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  33.26 
 
 		 567 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  31.79 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  30.69 
 
 		 506 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  31.58 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  30.51 
 
 		 507 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  30.51 
 
 		 507 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  30.19 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  31.24 
 
 		 488 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  29.76 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  30.12 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  28.71 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  30.31 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  30.02 
 
 		 521 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  31.45 
 
 		 512 aa  203  7e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  30.02 
 
 		 521 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  30.31 
 
 		 500 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  30.47 
 
 		 528 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  30.16 
 
 		 514 aa  203  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  29.92 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  29.66 
 
 		 514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  29.92 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  29.78 
 
 		 509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  30.11 
 
 		 512 aa  199  9e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  29.7 
 
 		 519 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  29.75 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  29.6 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  28.57 
 
 		 519 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  28.1 
 
 		 504 aa  193  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  27.02 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  23.17 
 
 		 499 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  24.28 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  24.11 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  24.28 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  25.96 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  23.63 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  23.53 
 
 		 518 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  23.98 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.04 
 
 		 494 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  26.26 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 		 461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  24.42 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  23.11 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  23.47 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.21 
 
 		 497 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  24.17 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  25.1 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  24.52 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  24.42 
 
 		 501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  23.96 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 504 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  23.81 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.24 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  24.63 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.47 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  23.78 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  23.51 
 
 		 500 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.09 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  22.17 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  23.42 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.86 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  20.94 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  22.8 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 		 502 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.68 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  22.27 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5173  non-specific serine/threonine protein kinase  22.49 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  22.59 
 
 		 481 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 		 480 aa  97.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  26.1 
 
 		 479 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 		 265 aa  95.1  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  21.14 
 
 		 535 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  23.4 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  27.2 
 
 		 235 aa  90.5  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  21.55 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.31 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  23.61 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  28.27 
 
 		 224 aa  88.6  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  21.97 
 
 		 481 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  28.21 
 
 		 243 aa  87.8  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  21.55 
 
 		 481 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>