255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05441 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  76.95 
 
 
520 aa  795    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  87.89 
 
 
500 aa  897    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  77.57 
 
 
519 aa  798    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  90.57 
 
 
512 aa  919    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  91.8 
 
 
512 aa  928    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  86.01 
 
 
498 aa  887    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  79.01 
 
 
519 aa  819    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  77.37 
 
 
521 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  76.95 
 
 
519 aa  799    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  77.37 
 
 
521 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  85.8 
 
 
509 aa  885    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  85.8 
 
 
509 aa  886    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  88.3 
 
 
500 aa  902    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  100 
 
 
488 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  88.48 
 
 
512 aa  906    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  78.03 
 
 
528 aa  803    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  86.21 
 
 
509 aa  889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  78.19 
 
 
514 aa  800    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  56.26 
 
 
510 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  56.06 
 
 
510 aa  565  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  55.56 
 
 
506 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  55.24 
 
 
514 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  55.35 
 
 
507 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  54.3 
 
 
509 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  55.35 
 
 
507 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  53.94 
 
 
504 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  38.91 
 
 
563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  37.7 
 
 
573 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  38.37 
 
 
574 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  37.68 
 
 
562 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  39.18 
 
 
570 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  39.18 
 
 
570 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  34.98 
 
 
584 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  38.16 
 
 
569 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  38.28 
 
 
574 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  38.61 
 
 
560 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  35.83 
 
 
575 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  37.87 
 
 
567 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  35.49 
 
 
559 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  36.13 
 
 
562 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  35.98 
 
 
565 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  35.99 
 
 
575 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  35.99 
 
 
575 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  36.22 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  30.47 
 
 
484 aa  223  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  31.24 
 
 
550 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  27.7 
 
 
535 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  28.25 
 
 
518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  26.63 
 
 
499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.22 
 
 
478 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  29.66 
 
 
494 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  26.57 
 
 
489 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  28.66 
 
 
492 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 
498 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.46 
 
 
498 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  37.82 
 
 
259 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  27.22 
 
 
492 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  26.12 
 
 
483 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  25.72 
 
 
482 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 
505 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  28.77 
 
 
494 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  26.86 
 
 
496 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  28.36 
 
 
467 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  25.77 
 
 
496 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
500 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 
532 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
497 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 
504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  26.76 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  25.93 
 
 
502 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 
504 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  26.79 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  25.97 
 
 
501 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  27.55 
 
 
494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  25.51 
 
 
506 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 
481 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  25.87 
 
 
508 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  25.51 
 
 
497 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 
502 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
481 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  25.05 
 
 
505 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
481 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  26.05 
 
 
481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 
507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  25.97 
 
 
520 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 
520 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.52 
 
 
482 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 
461 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.42 
 
 
459 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  26.07 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.08 
 
 
463 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
480 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
503 aa  133  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.21 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  25.05 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  23.61 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  26.77 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  31.03 
 
 
402 aa  126  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>