283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1808 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  100 
 
 
454 aa  926    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  32.47 
 
 
459 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  28.17 
 
 
467 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  26.65 
 
 
518 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  27.7 
 
 
510 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  27.66 
 
 
510 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  28.09 
 
 
506 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  27.41 
 
 
507 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  27.41 
 
 
507 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  27.92 
 
 
563 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  28.24 
 
 
497 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
498 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.35 
 
 
560 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  26.61 
 
 
519 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  26.84 
 
 
562 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  26.61 
 
 
519 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  26.02 
 
 
519 aa  152  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.38 
 
 
520 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.02 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  25.81 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  25.81 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  27.39 
 
 
489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  24.84 
 
 
504 aa  146  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
497 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  27.57 
 
 
559 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  25.97 
 
 
514 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  25.16 
 
 
514 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  26.82 
 
 
574 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  29.89 
 
 
569 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  25.38 
 
 
494 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
504 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  26.28 
 
 
483 aa  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  25.11 
 
 
498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  24.89 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  25.69 
 
 
482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  24.89 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  24.73 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  26.64 
 
 
574 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  28.51 
 
 
494 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  25.21 
 
 
512 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  24.79 
 
 
535 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  27.23 
 
 
584 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  27.06 
 
 
492 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  24.68 
 
 
509 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  26.48 
 
 
496 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.46 
 
 
570 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  26 
 
 
573 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5173  non-specific serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
501 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  24.79 
 
 
512 aa  136  9e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  24.35 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  24.89 
 
 
501 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  24.36 
 
 
512 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.1 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  35.16 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  27.53 
 
 
567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.79 
 
 
494 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  27.06 
 
 
575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  27.06 
 
 
575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.09 
 
 
570 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  25.21 
 
 
492 aa  134  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 
502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  26 
 
 
502 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  26.35 
 
 
575 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  24.09 
 
 
481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.86 
 
 
484 aa  130  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  23.5 
 
 
500 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.56 
 
 
496 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  27.94 
 
 
501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.74 
 
 
499 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  23.61 
 
 
488 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  23.5 
 
 
500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 
481 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  24.78 
 
 
565 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  24.61 
 
 
474 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
500 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 
481 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  26.22 
 
 
482 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 
481 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  22.98 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  25.81 
 
 
562 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.04 
 
 
532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0716  KaiC  35.1 
 
 
208 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  24.31 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  24.52 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  25.11 
 
 
508 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.01 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  27.62 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
503 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  25.26 
 
 
481 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  26.55 
 
 
497 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 
494 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 
503 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 
489 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  22.43 
 
 
504 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  24.31 
 
 
520 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  24.31 
 
 
520 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 
480 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  24.41 
 
 
505 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>