153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0716 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0716  KaiC  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  40.78 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  33.65 
 
 		 467 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  35.1 
 
 		 454 aa  118  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  31.25 
 
 		 494 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  31.78 
 
 		 518 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  31.53 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  30.41 
 
 		 497 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  31.28 
 
 		 519 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  30.18 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  29.39 
 
 		 519 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  30.36 
 
 		 496 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  29.46 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  28.96 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  28.96 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  27.44 
 
 		 519 aa  81.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  29.41 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  28.07 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  30.22 
 
 		 512 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.89 
 
 		 459 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  31 
 
 		 508 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  29.96 
 
 		 499 aa  78.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  30.13 
 
 		 497 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  29.65 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  26.27 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  27.62 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  31.84 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  29.95 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  30.87 
 
 		 532 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  31.39 
 
 		 514 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 		 509 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  30.84 
 
 		 498 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  26.48 
 
 		 506 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 504 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  29.86 
 
 		 504 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  31.84 
 
 		 510 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.26 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  29.28 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  28.96 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  30.43 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  26.15 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  29.36 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  29.36 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  26.15 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  24.49 
 
 		 491 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 		 498 aa  72  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 504 aa  71.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 481 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  31.88 
 
 		 506 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  26.84 
 
 		 505 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  30.6 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  28.7 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  28.44 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  26.79 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 500 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  25.24 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  29.46 
 
 		 478 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  28.32 
 
 		 488 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  31.44 
 
 		 505 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  31.17 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  31.44 
 
 		 520 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 		 520 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 507 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  29.82 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  25.82 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  27.51 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 502 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  27.51 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5173  non-specific serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 501 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  25.23 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 		 481 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  25.99 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  28.18 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  29.61 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 		 535 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  25.79 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  27.93 
 
 		 559 aa  62  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  29.28 
 
 		 584 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  28.31 
 
 		 474 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  27.23 
 
 		 402 aa  62  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  25.47 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  28.51 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  25.12 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.23 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  25.23 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  28.38 
 
 		 575 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>