280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1062 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  81.58 
 
 		 228 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  55.51 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  59.83 
 
 		 231 aa  280  9e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  40.68 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  38.43 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  30.13 
 
 		 506 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  34.91 
 
 		 496 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 498 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  32.62 
 
 		 506 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  32.07 
 
 		 498 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  29.67 
 
 		 507 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  29.68 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  34.58 
 
 		 502 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  28.51 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  29.67 
 
 		 507 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  30.47 
 
 		 499 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  33.17 
 
 		 505 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  33.19 
 
 		 501 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  26.78 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  30.81 
 
 		 514 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  30.9 
 
 		 508 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  30.97 
 
 		 520 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.47 
 
 		 478 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 		 504 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 520 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 507 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 502 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  31.43 
 
 		 481 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  31.65 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  28.39 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  28.82 
 
 		 496 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 480 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  28.38 
 
 		 362 aa  92  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  28.45 
 
 		 505 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.45 
 
 		 497 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 489 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 		 497 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  26.75 
 
 		 494 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  27.59 
 
 		 510 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 500 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  30.26 
 
 		 535 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  30.6 
 
 		 532 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  28.23 
 
 		 512 aa  89.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  34.32 
 
 		 501 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  26.03 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  27.59 
 
 		 510 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  29.54 
 
 		 480 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  27.27 
 
 		 509 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.67 
 
 		 494 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  26.73 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  28.23 
 
 		 498 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  28.23 
 
 		 512 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  28.57 
 
 		 509 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  27.75 
 
 		 509 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  27.75 
 
 		 509 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  28.21 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  28.21 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  27.59 
 
 		 482 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  27.27 
 
 		 488 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.11 
 
 		 505 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 504 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 503 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  26.2 
 
 		 512 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 503 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  23.35 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  25.6 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  30.17 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  26.32 
 
 		 500 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  26.32 
 
 		 500 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.32 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  28.45 
 
 		 489 aa  82  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25.6 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 		 570 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  26.55 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.95 
 
 		 574 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  27.59 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  27.68 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.36 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  28.63 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  44.59 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  27.04 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  27.75 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  27.88 
 
 		 479 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25.56 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.07 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  29.07 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  25.65 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  24.78 
 
 		 472 aa  72.8  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  27.19 
 
 		 474 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  25.36 
 
 		 519 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  27.4 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.56 
 
 		 520 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  28.07 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>