248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2357 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
232 aa  477  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  62.5 
 
 
234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  59.05 
 
 
237 aa  299  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  42.79 
 
 
402 aa  201  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  41.67 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  41.48 
 
 
344 aa  199  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  40.17 
 
 
362 aa  194  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  39.74 
 
 
472 aa  190  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  34.46 
 
 
238 aa  115  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  32.34 
 
 
509 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  31.06 
 
 
498 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  32.16 
 
 
518 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  31.49 
 
 
509 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  29.66 
 
 
512 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  29.33 
 
 
506 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  30.8 
 
 
509 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  30.43 
 
 
467 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  32.26 
 
 
289 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 
507 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 
507 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  29.49 
 
 
512 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  31.39 
 
 
287 aa  99.8  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  29.54 
 
 
488 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.83 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.83 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  29.11 
 
 
266 aa  99.4  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  28.81 
 
 
512 aa  99.4  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  30.7 
 
 
562 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  27.59 
 
 
519 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  27.23 
 
 
510 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  27.23 
 
 
510 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  33.79 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  27.57 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  27.97 
 
 
500 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30.26 
 
 
570 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  27.97 
 
 
500 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  27.71 
 
 
519 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  30.74 
 
 
501 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  32.31 
 
 
497 aa  95.1  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.76 
 
 
570 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  33.19 
 
 
575 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  29.61 
 
 
574 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  25.97 
 
 
519 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  30.17 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  26.99 
 
 
459 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  30.53 
 
 
584 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  29.74 
 
 
560 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  26.43 
 
 
504 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  32.47 
 
 
569 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  28.39 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  28.07 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  26.84 
 
 
514 aa  92.8  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.29 
 
 
528 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.87 
 
 
573 aa  92  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  26.43 
 
 
514 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  33.85 
 
 
364 aa  91.7  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  26.72 
 
 
521 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  26.72 
 
 
521 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  30.22 
 
 
484 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.07 
 
 
563 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.45 
 
 
565 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  26.47 
 
 
235 aa  89  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  28.81 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  32.75 
 
 
574 aa  88.6  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  31.53 
 
 
258 aa  88.2  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  32.02 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  30.28 
 
 
482 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  27.71 
 
 
509 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
500 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  27.82 
 
 
494 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  27.82 
 
 
494 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.29 
 
 
520 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  31.03 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  29.22 
 
 
489 aa  86.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  26.47 
 
 
501 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.26 
 
 
497 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.22 
 
 
559 aa  85.5  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  31.96 
 
 
320 aa  85.1  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 
575 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 
575 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  31.82 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 
497 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  30.22 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  26.72 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  29.26 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  27.13 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  29.87 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.93 
 
 
498 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  27.75 
 
 
491 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  25.76 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 
562 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  28.02 
 
 
567 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  28 
 
 
478 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  29.54 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  31.9 
 
 
285 aa  82  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
507 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  31.87 
 
 
505 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  29.15 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>