282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1678 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  84.4 
 
 		 281 aa  501  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  82.98 
 
 		 293 aa  498  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  84.1 
 
 		 285 aa  498  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  73.68 
 
 		 286 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  72.27 
 
 		 280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  66.09 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  66.09 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  65.15 
 
 		 250 aa  333  3e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  35.06 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  34.75 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  34.8 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  32.24 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  32.77 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  33.89 
 
 		 362 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  34.03 
 
 		 528 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  31.2 
 
 		 514 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  31.7 
 
 		 519 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  29.66 
 
 		 402 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  31.65 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  30.51 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  31.14 
 
 		 507 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  33.06 
 
 		 514 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  31.14 
 
 		 507 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  30.8 
 
 		 519 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  32.77 
 
 		 520 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  32.35 
 
 		 519 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  31.44 
 
 		 510 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  33.19 
 
 		 521 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  33.19 
 
 		 521 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  31.58 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  30.92 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  31.98 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  32.53 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  31 
 
 		 509 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.13 
 
 		 510 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  32.79 
 
 		 584 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  27.67 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.58 
 
 		 512 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  29.62 
 
 		 504 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  29.24 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  29.34 
 
 		 472 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  27.27 
 
 		 224 aa  89.7  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  29.17 
 
 		 512 aa  89.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.2 
 
 		 559 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  26.97 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  31.56 
 
 		 562 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  30.51 
 
 		 501 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  23.63 
 
 		 459 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  29.63 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  31.65 
 
 		 573 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  30.67 
 
 		 500 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  27.85 
 
 		 482 aa  85.9  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  29.88 
 
 		 509 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  30.17 
 
 		 512 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  28.63 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  30.25 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  29.05 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  29.88 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  27.87 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  29.88 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  30.71 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  32.39 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  27.5 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  32.07 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  29.88 
 
 		 509 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.76 
 
 		 575 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  26.07 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  34.03 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  28.93 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  29.88 
 
 		 562 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  30.99 
 
 		 567 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  29.15 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  30 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  28.88 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  31.02 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  29.71 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  30.25 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.75 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  30.58 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  30.58 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  29.29 
 
 		 574 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  29.22 
 
 		 570 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  28.83 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 504 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  28.31 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  27.56 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  30.05 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1964  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  27.93 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  29.96 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  28.69 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  28.82 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  30.21 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  29.96 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.97 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>