More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0710 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  89.51 
 
 		 271 aa  511  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  90.26 
 
 		 267 aa  508  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  89.51 
 
 		 267 aa  509  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  56.72 
 
 		 295 aa  310  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  38.66 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  39.16 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.34 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.34 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  29.85 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  31.15 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  32.79 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  33.6 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  32.53 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  29.96 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  28.46 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  26.49 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  27.07 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  25.1 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  40.79 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  27.47 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  39.47 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  27.17 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  23.6 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  25.09 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  23.28 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  24.9 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  24.62 
 
 		 535 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  23.66 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0714  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  26.39 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 		 488 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  25.19 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  25.19 
 
 		 512 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  27.76 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  25.5 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  24.44 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  24.03 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  23.48 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  24.81 
 
 		 520 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 519 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  40.24 
 
 		 462 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  35 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  35 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  26.22 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  26.59 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  35.37 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  29.94 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  36.84 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  23.08 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  27.82 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  23.7 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  24.23 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  34.52 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.88 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 519 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  21.64 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  24.31 
 
 		 519 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  36.79 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  30.34 
 
 		 492 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  27.17 
 
 		 480 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  26.3 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  36.59 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  24.62 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  34.21 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  38.27 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  27.11 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  22.76 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  34.82 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  22.06 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  33.33 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  34.62 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  34.62 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  22.73 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.01 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  40.26 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  27.1 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1613  putative circadian clock protein, KaiC  25.33 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  22.99 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  36.94 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  38.46 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.34 
 
 		 364 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  23.7 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  37.86 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  33.98 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  22.52 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  25.49 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  36.7 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  25.56 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  39.51 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  22.52 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  31.53 
 
 		 562 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  24.7 
 
 		 498 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  21.72 
 
 		 509 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  38.96 
 
 		 560 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>