94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0714 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0714  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  26.36 
 
 
254 aa  89  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  26.67 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  25.45 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  26.39 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  26.25 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  27.8 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  27.54 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  26.45 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  24.29 
 
 
559 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  25.21 
 
 
501 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  23.14 
 
 
494 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  33.8 
 
 
301 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 
514 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 
500 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  25.82 
 
 
505 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  24.59 
 
 
519 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  25.11 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  23.14 
 
 
494 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  24.4 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  24.22 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25.53 
 
 
344 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  24.9 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  24.48 
 
 
567 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  22.65 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 
575 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  24.9 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  24.9 
 
 
575 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  24.41 
 
 
509 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  25.3 
 
 
402 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  25.11 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0267  hypothetical protein  22.22 
 
 
221 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.583033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  22.75 
 
 
574 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  24.71 
 
 
506 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 
504 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  23.29 
 
 
500 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  26.24 
 
 
505 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  23.9 
 
 
532 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  23.53 
 
 
500 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  37.66 
 
 
510 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
498 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  23.66 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  27.49 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  24.41 
 
 
498 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  24.88 
 
 
504 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  37.66 
 
 
510 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  21.96 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 
520 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  23.24 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  24.39 
 
 
528 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  24.79 
 
 
520 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  36.49 
 
 
507 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  22.89 
 
 
488 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 
507 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  36.49 
 
 
507 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  26 
 
 
489 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  22.8 
 
 
512 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  24.41 
 
 
509 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  34.78 
 
 
498 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  24.59 
 
 
519 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  24.48 
 
 
562 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  26.8 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  24.22 
 
 
512 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  22.73 
 
 
252 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  24.02 
 
 
509 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  22.09 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  24.5 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  22.8 
 
 
512 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  38.16 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  24.7 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  34.07 
 
 
494 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 
503 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  25.45 
 
 
514 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  22.41 
 
 
584 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  24.17 
 
 
570 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 
496 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  21.32 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
480 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  26.21 
 
 
569 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
497 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  25.6 
 
 
508 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25 
 
 
550 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  36 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  22.82 
 
 
565 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  23.63 
 
 
563 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 
570 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  23.65 
 
 
492 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  34.62 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  35.11 
 
 
239 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  23.65 
 
 
562 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  27.46 
 
 
505 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  22.95 
 
 
519 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>