39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0267 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0267  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.583033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0101  hypothetical protein  41.05 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2153  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3171  hypothetical protein  34.74 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1665  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0714  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  22.22 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  46.3 
 
 		 494 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  36.23 
 
 		 535 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  45.65 
 
 		 481 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.64 
 
 		 480 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 		 479 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  21.72 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5173  non-specific serine/threonine protein kinase  41.1 
 
 		 501 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  47.83 
 
 		 480 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 461 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.83 
 
 		 503 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 		 503 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0519  hypothetical protein  26.76 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  44.19 
 
 		 301 aa  45.1  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  38.36 
 
 		 494 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  34.86 
 
 		 518 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1105  DNA repair protein RadA  40.98 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.210727  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0808  KaiC-like transcriptional regulator  25.52 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.105234  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  29.73 
 
 		 467 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  27.59 
 
 		 509 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  43.18 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  47.83 
 
 		 496 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  42.31 
 
 		 494 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  47.62 
 
 		 574 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  41.86 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  36.76 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  40.98 
 
 		 532 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  45.24 
 
 		 280 aa  42  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  42.86 
 
 		 267 aa  42  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  44.23 
 
 		 489 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  40.82 
 
 		 266 aa  42  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  34.67 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>