21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0101 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0101  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2153  hypothetical protein  47.12 
 
 
194 aa  170  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0267  hypothetical protein  41.05 
 
 
221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.583033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3171  hypothetical protein  39.15 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  22.82 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1665  hypothetical protein  25.52 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  31.52 
 
 
265 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0519  hypothetical protein  22.84 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3464  hypothetical protein  23.35 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  25.99 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  26.05 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  23.91 
 
 
504 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0654  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  38.78 
 
 
593 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  47.83 
 
 
480 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.32 
 
 
574 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 
489 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  39.66 
 
 
480 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  23.48 
 
 
242 aa  42  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  23.48 
 
 
242 aa  42  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  41.3 
 
 
241 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  46.34 
 
 
301 aa  41.2  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>