More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0555 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 229 aa  463  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  41.67 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  41.23 
 
 		 402 aa  201  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  41.67 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  40.79 
 
 		 344 aa  198  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  39.3 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  39.3 
 
 		 472 aa  185  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  37.28 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  35.48 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  35.04 
 
 		 509 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  35.04 
 
 		 509 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  34.62 
 
 		 498 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  35.04 
 
 		 509 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  33.48 
 
 		 528 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  34.63 
 
 		 500 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  33.48 
 
 		 500 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  31.9 
 
 		 519 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 		 519 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  32.49 
 
 		 512 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  31.76 
 
 		 512 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  30.9 
 
 		 488 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  30.91 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  29.74 
 
 		 514 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  31.28 
 
 		 459 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  29.31 
 
 		 519 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  30.47 
 
 		 512 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  31 
 
 		 514 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  30.52 
 
 		 506 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  35.62 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  32.34 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  32.34 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  29.31 
 
 		 521 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  29.31 
 
 		 521 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  28.88 
 
 		 520 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  30.05 
 
 		 507 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  30.05 
 
 		 507 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  32.77 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  33.19 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  30.2 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  28.83 
 
 		 467 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  32.34 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  29.91 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.91 
 
 		 510 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  32.74 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  29.91 
 
 		 510 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  34.23 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  31.51 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 		 498 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.57 
 
 		 504 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  27.57 
 
 		 509 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  27.35 
 
 		 496 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  27.97 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  31.14 
 
 		 574 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  30.26 
 
 		 565 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  29.15 
 
 		 454 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  29.18 
 
 		 287 aa  95.9  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  31.44 
 
 		 563 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  29.18 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.5 
 
 		 505 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 497 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  31.56 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  30.7 
 
 		 573 aa  92.8  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  30.22 
 
 		 562 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  28.25 
 
 		 285 aa  92.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  29.78 
 
 		 570 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  30 
 
 		 562 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  29.07 
 
 		 574 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  30.33 
 
 		 258 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  29.11 
 
 		 478 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  32.49 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  31 
 
 		 575 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  27.23 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  26.97 
 
 		 494 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  30.08 
 
 		 559 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  31 
 
 		 575 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  30.05 
 
 		 482 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  28.25 
 
 		 518 aa  89  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 		 258 aa  89  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  29.33 
 
 		 584 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  30.43 
 
 		 569 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.26 
 
 		 570 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  26.5 
 
 		 494 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  27.68 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 498 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  29.38 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  29.63 
 
 		 482 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  30.13 
 
 		 567 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  28.95 
 
 		 575 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  26.96 
 
 		 505 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  27.9 
 
 		 492 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 500 aa  85.1  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  30.34 
 
 		 235 aa  84.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  23.35 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 364 aa  85.1  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  28.32 
 
 		 560 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  25.42 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>