214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3108 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  49.79 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  39.83 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  30.14 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  30.34 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  28.4 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  28 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  28 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  27.6 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  30.21 
 
 		 584 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  29.2 
 
 		 482 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  29.17 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  27.92 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  27.92 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  28.63 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  30.38 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  27.9 
 
 		 574 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  26.25 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  27.9 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  21.79 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  27.9 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  28.32 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  27.9 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  26.05 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  26.4 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  25.76 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  25.73 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  29.66 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  25.75 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25.75 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  28.26 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.91 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  27.47 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.18 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  25.21 
 
 		 506 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  25.85 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  25.75 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  27.9 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  26.69 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  26.69 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  28.63 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  27.47 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  24.68 
 
 		 504 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  26.14 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  29.79 
 
 		 562 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  25.21 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  23.73 
 
 		 535 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  27.47 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  37.5 
 
 		 488 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  27.08 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  25.52 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  38.64 
 
 		 512 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  27.31 
 
 		 519 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  29.34 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  33.98 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  27.16 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  22.27 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  26.59 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  38.64 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  25.75 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  25.13 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  26.18 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.38 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.96 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  27.51 
 
 		 570 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 569 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  26.1 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  24.27 
 
 		 509 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  29.29 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  34.09 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  28.02 
 
 		 508 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  25.1 
 
 		 497 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  24.69 
 
 		 481 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  21.49 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.51 
 
 		 570 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 		 481 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  38.82 
 
 		 479 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  23.85 
 
 		 498 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  28.38 
 
 		 560 aa  62  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  25.64 
 
 		 496 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  23.93 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  36.71 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  23.18 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  23.93 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  26.67 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  23.85 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.85 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  23.18 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>