200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0297 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
320 aa  652    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  60.64 
 
 
276 aa  308  9e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  59.92 
 
 
281 aa  305  7e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  57.41 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  58.27 
 
 
280 aa  301  7.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  44.95 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  40 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  42.17 
 
 
285 aa  182  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  38.98 
 
 
258 aa  155  9e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  36.57 
 
 
258 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  39.58 
 
 
257 aa  151  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  36.19 
 
 
258 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  34.16 
 
 
500 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  33.5 
 
 
500 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  31.54 
 
 
510 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.56 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.56 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  31.33 
 
 
512 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  32.86 
 
 
512 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  32.27 
 
 
488 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  32.41 
 
 
559 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  31.65 
 
 
509 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  30.29 
 
 
510 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  33.19 
 
 
266 aa  93.2  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  31.65 
 
 
509 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  30.73 
 
 
498 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  31.19 
 
 
509 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 
506 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  30.95 
 
 
512 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  34.86 
 
 
494 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  34.29 
 
 
494 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  29.41 
 
 
514 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  34.56 
 
 
567 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  32.72 
 
 
584 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  33.64 
 
 
575 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  33.64 
 
 
575 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  32.29 
 
 
574 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  31.96 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  32.72 
 
 
569 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  31.22 
 
 
509 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  30.08 
 
 
234 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  30.43 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  30.43 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30.08 
 
 
570 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  30.23 
 
 
467 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  36.49 
 
 
484 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  29.86 
 
 
519 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  34.55 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  32.72 
 
 
562 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  31.82 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  32.87 
 
 
574 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  26.32 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  29.92 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  30.2 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  30.3 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  30.85 
 
 
565 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  31.16 
 
 
528 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  28.68 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.51 
 
 
575 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  30.67 
 
 
562 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  29.91 
 
 
573 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  32.51 
 
 
496 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  29.72 
 
 
520 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  31.98 
 
 
498 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  31.12 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  29.29 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  28.76 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  27.66 
 
 
570 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  29.82 
 
 
563 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  36.17 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  30.87 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
503 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 
503 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  28.91 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  27.02 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  29.25 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  30.65 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  28.45 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  29.96 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  28.45 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  31.91 
 
 
502 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
497 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  26.67 
 
 
532 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  27.2 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  33.7 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  29.07 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  27.78 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  27.08 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  34.59 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  30.69 
 
 
501 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  28.42 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  29.12 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>