156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0456 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 285 aa  570  1e-161  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  51.88 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  49.58 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  49.16 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  46.64 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  44.94 
 
 		 364 aa  218  7e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  48.23 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  42.17 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  40.66 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  40.76 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  40.25 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  39.83 
 
 		 281 aa  168  8e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  32.92 
 
 		 509 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  32.2 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  32.73 
 
 		 519 aa  99  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  33.03 
 
 		 509 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  33.49 
 
 		 509 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  33.49 
 
 		 512 aa  96.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  33.81 
 
 		 528 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  32.88 
 
 		 509 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  31.42 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  34.22 
 
 		 500 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 498 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  34.22 
 
 		 500 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  29.28 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 519 aa  93.6  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  32.41 
 
 		 250 aa  94  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  34.02 
 
 		 488 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  33.51 
 
 		 512 aa  92.8  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  32.58 
 
 		 512 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  28.25 
 
 		 229 aa  92.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  33.01 
 
 		 519 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  31.34 
 
 		 521 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  30 
 
 		 514 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  31.34 
 
 		 521 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  31.58 
 
 		 344 aa  89.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.64 
 
 		 510 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  30.64 
 
 		 510 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  32.26 
 
 		 520 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  35.11 
 
 		 402 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  29.11 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  29.11 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  31.78 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 		 570 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  30.32 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  27.04 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  32.34 
 
 		 472 aa  82.4  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  30.99 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  28.69 
 
 		 484 aa  82  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  31.9 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  30.05 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  33.51 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  30.74 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  30.88 
 
 		 560 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  32.06 
 
 		 575 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  30.05 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  26.94 
 
 		 506 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  27.78 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  30.77 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  31.95 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  31.46 
 
 		 574 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  31.6 
 
 		 563 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  29.52 
 
 		 559 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  30.24 
 
 		 575 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  30.39 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  30.37 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  27.83 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  29.61 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  30.09 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  30.81 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  27.38 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  27.48 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  26.79 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  25.91 
 
 		 507 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  25.91 
 
 		 507 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  27.96 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  29.65 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  27.47 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  28.26 
 
 		 573 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  29.25 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  29.52 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  26.07 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  27.1 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  29.28 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  31.58 
 
 		 550 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  25.29 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  27.59 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  26.55 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  26.18 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  28.03 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  27.19 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  29.33 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  26.75 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  29.49 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  32.37 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  28.91 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  27.95 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  27.03 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>