More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1993 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 295 aa  610  1e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  56.72 
 
 		 277 aa  310  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  55.6 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  56.6 
 
 		 267 aa  308  9e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  54.24 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  38.55 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  35.98 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  30.27 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  30.27 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  28.46 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  26.48 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  27.67 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  28.17 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  28.29 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  27.91 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  28.94 
 
 		 528 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  26.72 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  27.69 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  26.25 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  26.62 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  26.74 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  27.8 
 
 		 519 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  26 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  26.24 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  26.62 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  26.36 
 
 		 488 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  24.33 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  26.24 
 
 		 500 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  26.62 
 
 		 509 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  26.85 
 
 		 512 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  26.24 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  28.24 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  27.06 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  25.29 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  26.32 
 
 		 559 aa  68.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  26.34 
 
 		 519 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0714  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  26.67 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  26.34 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  28.41 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.24 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  29.06 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  25.77 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  29.41 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  26.59 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3110  hypothetical protein  36.71 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0481513  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  28.89 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  25.67 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  25.57 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  23.13 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  26.67 
 
 		 520 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  32.81 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  27.46 
 
 		 467 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  23.72 
 
 		 584 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  24.52 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  25.29 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.94 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  25.27 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  36.11 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  36.7 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  22.96 
 
 		 506 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  26.95 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  24.24 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  25.88 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  25.88 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25.74 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  26.09 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  24.9 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  35.62 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  23.28 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  35.9 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  31.3 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  35.29 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  26.1 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  23.92 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0949  putative circadian clock protein, KaiC  26.2 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.077218  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  26.19 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  25.68 
 
 		 498 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  25.1 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  21.6 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  25.65 
 
 		 499 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  36.62 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  25.48 
 
 		 480 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 		 480 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  22.13 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  23.41 
 
 		 575 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  24.71 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  39.47 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 504 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  27.03 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  32.11 
 
 		 454 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  23.16 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  21.98 
 
 		 510 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 518 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  23.83 
 
 		 563 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  21.6 
 
 		 402 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  26.56 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  20.15 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  31.54 
 
 		 234 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>