58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1319 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  44.74 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  38.33 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  37.44 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  37.89 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  36.56 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  39.21 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  37.34 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  35.86 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  35.56 
 
 		 253 aa  168  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  34.19 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  36.77 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  29.68 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  30.04 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  27.4 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  29.24 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  29.09 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  27.43 
 
 		 262 aa  85.5  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  27.98 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  26.05 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  38.55 
 
 		 267 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  38.55 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  38.27 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  38.27 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  36.62 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  28.89 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  24.81 
 
 		 507 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  24.81 
 
 		 507 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  27.64 
 
 		 528 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  28.46 
 
 		 519 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  28.66 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  24.06 
 
 		 584 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  25.66 
 
 		 562 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  24.06 
 
 		 560 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  24.06 
 
 		 563 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  24.03 
 
 		 506 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  33.77 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  24.03 
 
 		 562 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  25.42 
 
 		 550 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 484 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  26.06 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  31.4 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  23.72 
 
 		 519 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  23.12 
 
 		 492 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  30.4 
 
 		 466 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  41.94 
 
 		 484 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  26.02 
 
 		 519 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  30.53 
 
 		 459 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  27.71 
 
 		 454 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  26.02 
 
 		 514 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  29.61 
 
 		 452 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  51.11 
 
 		 448 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.84 
 
 		 480 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  27.63 
 
 		 514 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  27.14 
 
 		 575 aa  41.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 		 446 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  43.86 
 
 		 446 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>