74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3413 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  50.83 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  48.77 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  46.56 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  45.56 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  36.77 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  32.44 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  30.17 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  28.88 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  29.31 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  28.57 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  31.6 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  25.21 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  25.96 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  24.07 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  22.59 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  23.01 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  25.85 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  20.17 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  20.72 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  40 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  42.25 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  24.51 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  38.57 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  40 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  34.25 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  30.23 
 
 		 520 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  25.36 
 
 		 512 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 457 aa  48.9  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0364  DNA repair protein RadA  26.83 
 
 		 423 aa  48.5  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.930824  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  25.29 
 
 		 509 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  26.09 
 
 		 550 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 448 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  27.21 
 
 		 514 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  23.91 
 
 		 509 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.55 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  24.12 
 
 		 500 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  29.01 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  24.12 
 
 		 509 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  23.53 
 
 		 498 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  24.12 
 
 		 500 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 496 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  26.05 
 
 		 521 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  27.41 
 
 		 494 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  25.27 
 
 		 574 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.05 
 
 		 528 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  26.05 
 
 		 521 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0415  DNA repair protein RadA  25.11 
 
 		 470 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  27.17 
 
 		 584 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  25.79 
 
 		 519 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  37.7 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  32.76 
 
 		 466 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  30.97 
 
 		 562 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  30.25 
 
 		 457 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  26.79 
 
 		 457 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  32.29 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  38.96 
 
 		 457 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  23.53 
 
 		 512 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  34.52 
 
 		 457 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  23.08 
 
 		 575 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  23.53 
 
 		 512 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  28.48 
 
 		 574 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  28.92 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  25.9 
 
 		 474 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  22.46 
 
 		 488 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  40.74 
 
 		 470 aa  42.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  23.96 
 
 		 518 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  29.55 
 
 		 447 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  25.86 
 
 		 467 aa  42  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  30.28 
 
 		 457 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  25.86 
 
 		 467 aa  42  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.86 
 
 		 654 aa  41.6  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  40.74 
 
 		 448 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 481 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>