More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1479 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  918    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  47.26 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 457 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  45.1 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  45.49 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  44.23 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  44.66 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  46.1 
 
 		 453 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  47.43 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  44.01 
 
 		 458 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  46.85 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  44.39 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  42.16 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  42.51 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.88 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  42.13 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  43.53 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  43.53 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  42.83 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  44.3 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  43.3 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 		 489 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  45.92 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  42.26 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  42.13 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  45.6 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  44.01 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  43.9 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  43.29 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  45.09 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  45.26 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  43.46 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  44.32 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  44.65 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  43.78 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  46.77 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  46.77 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  44.18 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  41.85 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  43.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  43.23 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  42.7 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  43.82 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  42.03 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  40.98 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  43.33 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0314  DNA repair protein RadA  42.08 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  43.65 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  41.98 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  41.14 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  41.98 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  41.54 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  41.54 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  42.6 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  40.96 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  41.54 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  41.54 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  41.47 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  41.76 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  41.76 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  40.35 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  41.36 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  43.83 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  42.41 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  41.76 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  41.76 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  41.01 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  41.86 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  41.89 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  41.54 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>