More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0084 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  698    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  73.9 
 
 		 458 aa  697    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  698    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  699    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  698    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  701    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  934    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  700    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  698    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  73.9 
 
 		 458 aa  697    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 		 458 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  86.18 
 
 		 484 aa  815    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  64.9 
 
 		 457 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  65.65 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  65.65 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  65.65 
 
 		 457 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  64.46 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  63.58 
 
 		 453 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  59.65 
 
 		 470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  60.71 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  65.5 
 
 		 415 aa  545  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  64.78 
 
 		 408 aa  540  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  57.08 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  57.05 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  57.21 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  55.48 
 
 		 453 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  55.7 
 
 		 459 aa  522  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  56.86 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  55.99 
 
 		 448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 460 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  56.39 
 
 		 449 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  53.61 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  55.09 
 
 		 489 aa  501  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  56.48 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  54.82 
 
 		 457 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  56.58 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  54.19 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  50.41 
 
 		 520 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  54.91 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  50.53 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  50.53 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  52.33 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  54.07 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  51.2 
 
 		 455 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  53.58 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  52.65 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  52.1 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  50.65 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  50.92 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  53.45 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 		 451 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  51.88 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  50.83 
 
 		 517 aa  471  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  48.51 
 
 		 518 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  53.29 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  51.1 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  53.13 
 
 		 452 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  53.13 
 
 		 452 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  53.29 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  52.63 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  51.1 
 
 		 494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  49.05 
 
 		 478 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  51.51 
 
 		 463 aa  441  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  50.56 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  48.03 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  49.18 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.03 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  49.02 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  50.69 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  47.4 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  46.9 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  47.58 
 
 		 456 aa  435  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  48.13 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  46.61 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  50.65 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.8 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>