More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0364 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0364  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 423 aa  837    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.930824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  44.88 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  43.19 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  42.16 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0725  DNA repair protein RadA  46.52 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.573014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0749  DNA repair protein RadA  45.68 
 
 		 441 aa  300  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.925672  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  40.2 
 
 		 451 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  42.34 
 
 		 489 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  41.39 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  40.2 
 
 		 451 aa  298  8e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  41.67 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  41.73 
 
 		 462 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  41.85 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  41.65 
 
 		 463 aa  295  7e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  40.83 
 
 		 484 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  41.65 
 
 		 463 aa  295  7e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  40.35 
 
 		 451 aa  295  9e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  37.88 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  41.48 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.16 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  42.9 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  41.9 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  39.14 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  40.16 
 
 		 456 aa  292  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  41.16 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  38.24 
 
 		 465 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  40.16 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  38 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  40.69 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  40.05 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  41.16 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  37.99 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  40.1 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  40.43 
 
 		 459 aa  289  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 482 aa  289  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  39.69 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  38.95 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  39.16 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  36.97 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  40.43 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  40.25 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  37.62 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  38.33 
 
 		 455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  39.89 
 
 		 459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  38.64 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  39.5 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  40.98 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  38.64 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  42.58 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  41.78 
 
 		 462 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  40.17 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  36.94 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  40.55 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  42.15 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  38.46 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  42.34 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  39.18 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  39.39 
 
 		 514 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  39.39 
 
 		 514 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  39.72 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  38.44 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  38.64 
 
 		 452 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  39.36 
 
 		 455 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  40 
 
 		 448 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  36.14 
 
 		 462 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  41.37 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  37.92 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  42.37 
 
 		 464 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  37.92 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  37.92 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  37.92 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  37.92 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  39.52 
 
 		 455 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  41.25 
 
 		 462 aa  279  7e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  37 
 
 		 455 aa  279  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  39.5 
 
 		 446 aa  279  7e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  41.18 
 
 		 446 aa  279  8e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  37.59 
 
 		 465 aa  278  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  39.52 
 
 		 455 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  38.87 
 
 		 477 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  37.66 
 
 		 460 aa  278  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  37.66 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>